December 2011

What's new for '+"resting" +"fMRI"' in PubMed

<?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?>

Regarding errors

Dear all,
when I was doing analysis of my own data a problem occur after realigned normalized and smoothed when it reached to the regress out nuisance co-variates . the error is :

??? Index exceeds matrix dimensions.

Error in ==> DPARSFA_run at 1024

What's new for '+"resting" +"fMRI"' in PubMed

<?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?>

This message contains My NCBI what's new results from the
National Center for Biotechnology Information (NCBI)

Regarding analysis

Dear all,
I am a beginner of DPARSF. when I was analyzing my data found an error in mapping functional connectivity .Please tell me about the procedure using REST how I can make the Covariate list to regress out nuissance covariates.
One more query regarding T1Raw analysis what parameters we have to set for T1 images analysis.

height extent correction

管理员好:
最近看文章很多是用height和extent校正的,也是用一个p值和一个cluster size,问下这个是不是和alphasim差不多或者就是指的alphasim呢?我记得ni上可能02年左右有一篇文章是专门介绍这个校正的原理的,不过具体操作也没有说。

这个校正该如何实现呢?用什么软件呢?或者extent这个cluster应该如何定义比较合理呢?

谢谢!

老师,想请教您2个关于ALFF的问题

老师,你好!
我现在在学习ALFF,在数据处理过程中遇到了一些问题,希望得到答案。谢谢您答疑解惑。
1. 被试数据扫描时间不同,在一次扫描过程中,有的被试是185volumes,而有的是200volumes。臧老师07年发的Brain Development文章中在遇到此类问题时的处理办法是:将具有200个volumes的被试的最后15个volumes去除,将所有被试的volume数保持相同,都为185volumes,然后进行下一步的分析。我想问的是,不去除这15个volumes可以嘛直接计算每个个体的ALFF map可以嘛?如果必须去除,原因又是什么?

DPARSFA 出错

Win XP ,Matlab 7.01 ,SPM5 ,REST 1.6

处理示例数据时出错

Read 3D EPI functional images: "H:\fMRI_tang\REST\ProcessingDemoData\test\FunImgARWS\Sub_001".??? Maximum variable size allowed by the program is exceeded.

Error in ==> repmat at 86
B = A(subs{:});

Error in ==> rest_to4d at 63
AllVolume =repmat(AllVolume, [1,1,1, size(ImgFileList,1)]);

求教关于REST ROI wise计算FC

求教各位老师,我用REST计算的ROI wise功能连接,结果是一系列的文本文件,请问这些文件怎么使用,怎么看的出两个ROI的相关性?

提取了90个 AAL 脑区 的时间序列以后

如果要自动两两计算它们之间的相关系数(做Small World 分析等等时候),处理这些时间序列的程序怎样写呢? 多谢指教

不同的TR扫描时间、不同扫描层数的静息态fMRI数据能否在一起分析?

老师您好:
我现在有一些静息态fMRI数据,但有的图像的TR时间和扫描层数和其他的数据不一样,能否将这些数据一起分析?会出现什么样的结果?