June 2012

Out of memory issues

Hi,
I am running DPARSF preprocessing for about 160 subjects. After 36 hours or so of running I am getting the following message:
Exception in thread "AWT-EventQueue-0" java.lang.OutOfMemoryError: Java heap space
Has anyone encountered such an issue? And if so any advice would be most appreciated.
Thanks,
Farras

怎么办啊,求助

DICOM整理时一直都不行
报错如下

Warning: Directory "F:\matlab7.0\work" already exists.
> In mkdir at 116
  In rest_DicomSorter_gui>btnRun_Callback at 175
  In gui_mainfcn at 75
  In rest_DicomSorter_gui at 26
??? Error using ==> images\private\dicom_set_mmeta_encoding
Could not determine file encoding.

Error in ==> rest_DicomSorter at 30
    dicominfotmp = dicominfo([rawdir,filesep,rawdata(i).name]);

求教

还是一个低级的问题,想各位老师求教。
我在DICOM文件整理时 选择DICOM Flie extension  后

要么显示 There is no data or non-data flies in this directory 要么就是运行之后 一直都在14% 一直不动,预计时间这些都是0

这是什么原因呢,是我的原始数据不对吗,需要怎么解决啊。这个问题很低级,各位老师勿笑!

还有一个问题 我的Matlab是7.0的 有必要升级更高的版本吗

请问经过EPI.nii模板标准化后的图像如何转化到individual space

各位老师好:
      我在dparsf中使用了EPI.nii标准化(Normalize by using EPI template),在MNI空间选择ROI区域后需要返回到individual space提取数据,请问应该如何操作?谢谢指点

求助,dicom文件整理时出错

老师好,我是一名新手,很多东西都在摸索中,向各位老师学习。
我在用rest dicom sorter 整理时出现报错,这要怎么解决呢???还有我的rest dicom sorter 不能显示如教学视频中的 add  recursively all sub-folders of a directory这些选项

Warning: Directory "D:\matlab7.0\work" already exists.
> In mkdir at 116

请问如何逐切片逐时间点提取时间序列

各位老师好:
      我在rest软件包中找到提取时间序列的程序(rest_ExtractROITC.m),发现程序是直接在一个时间点上取得均值作为当前时间点的值,即110个时间点,时间序列的长度即为110。如果我想按照逐层再逐时间点提取,即假设每个时间点61层(Z轴),共110个时间点,最后生成61×110长度的时间序列,应该如何做呢?谢谢

报结果

 老师你好,请问我用rest sliceviewer 的CLreporter报结果,用的Alphasim 校正,6平滑,p<0.01,应该是cluster size 40,rmm 5吧?那我的结果里面凡是小于40个cluster size 的脑区都不能报了吧?
  这里附上一个clusters

Number of voxels: 271
Peak MNI coordinate: -3 -90  30
Peak MNI coordinate region:  // Left Cerebrum // Occipital Lobe // Cuneus // Gray Matter // brodmann area 19 // Cuneus_L (aal)