DPARSFA error when stopping and restarting pipeline

Submitted by druzgal on Tue, 11/06/2012 - 02:27

DPARSFA has no problem processing a NIFTI dataset through the steps of Slice Timing and Realign. However, I get a reproducible error if I try to separate the steps in the pipeline. For example:

1) Processing the NIFTI dataset through Slice Timing alone works fine.

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Resting-state fMRI topics

关于Alphasim的问题

Submitted by limengsecret on Sun, 11/04/2012 - 20:35

老师：
      您好。我用VBM比较两组被试灰质差异，想用Alphasim进行校正。标准化后得到的图像voxel size为1*1*1。我有以下几个问题：

     1、在用REST Alphasim计算时，mask应该用全脑的还是用灰质的？

      2、如果选择灰质mask，是不是可以用spm/apriori中的灰质图，然后用rest中的image calculator，设定i1>0.2, 得到灰质mask后再重采样成1*1*1，这样制成的灰质mask是正确的吗？假如我做白质的分析，白质mask是不是可以直接对rest中提供的WhiteMask_09_61*73*61进行重采样？

      3、在REST Alphasim计算时，由于voxel size为1*1*1，那么rmm是不是可以选择2？

请老师指教，谢谢！

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