计算ReHo结果中VOXEL数目

大家好:
有没有好的方法或者软件包能计算一个cluster中灰质voxel的数目?或者有能用的程序段吗?
这个问题对我们的北京比较恼火 谢谢大家啦

 谢谢指导 我按照指示做了 有两点不清楚
1. 这个功能需要设置Cluster Size,其中的set rmm value (connectivity Criterion)我猜想是指cluster中体素连接的方式,surface/edge/corner connected分别指的是什么?一般大家都用那种呢?
2.报道的cluster size中我看还有white matter的数目,在文章中报道的时候需要剪掉白质的个数吗?CSF的情况呢?

谢谢

1. 这个功能需要设置Cluster Size,其中的set rmm value (connectivity Criterion)我猜想是指cluster中体素连接的方式,surface/edge/corner connected分别指的是什么?一般大家都用那种呢?
    surface/edge/corner connected分别表示两个立方体(voxel)只要有一个面或边或角是共用的,那么就认为这两个体素是连接着的。这几种连接方式你都是可以选择的,当然面连接是最严格的标准。

2.报道的cluster size中我看还有white matter的数目,在文章中报道的时候需要剪掉白质的个数吗?CSF的情况呢?
   
报告时报的应该是每个cluster内的voxel总数,不必将落在白质的剔除。如果你有整个cluster落在白质或CSF的情况,可以考虑在分析时用灰质模板做mask。