REST 软件相关分析

老师您好,根据视频中讲的,用REST Correlation Analysis,将功能连接图与一种评分做相关分析,得到R图,请问怎么从这个R图中得到结果呢?比如怎么看哪些脑区的连接强度与评分的相关具有显著性,以及得到这些脑区的信息。盼复,谢谢。

 给一个合适的阈值之后,survive的区脑就是结果了。这些脑区的信息,可以通过报告,得到一个表格,包括脑区名称、簇大小、peak voxel的r值等等。

谢谢老师,不过还是想问一下哈,是用Xjview打开R图,然后把p值和cluster size调一下对吗?您说的合适的阈值是指这个吗?

请问一下,做与症状评分的相关时,得到相关系数r=0.60345,写文章时要带上相应的P值,如P=0.0034,;但是我们取阈值时不是限定了P值吗,比如取P<0.05,cluster≥228voxels.这里P值取了0.05呀,怎么得到的P=0.0034呢?求解,谢谢各位老师。

 这要看具体情况。如果是voxel-by-voxel做相关分析,每个voxel都会有一个r值,报告这样的图的话,说清楚阈值(如p<0.05)就可了。但如果报告peak voxel的r值,或者ROI内平均的r值,其对应的具体的p值就应该单独报告出来。

  1. 谢谢臧老师,但是具体的P值从哪里可以看到呢?我用的rest1.6版本,可以得到具体的r值,但是怎么得到相对应的P值呢?查相应介值表?
  2. 还有取cluster的大小的问题,如用REST自带的default mask ,P取0.001,cluster≥13即为经过Alphsim校正了吗?
  3. 但是这样校正后,得到的两组间的差异脑区还是很多,能否将阈值再次升高到0.0001呢?这是cluster的大小如何定义呢?谢谢各位老师。

1、REST似乎不能提供观察每个体素的p值,只能查界值表。
2、是否通过了校正,要采用AlphaSim进行估计,或者采用其它的校正方法。如果校正之后,有差异的脑区仍然较多,当然可以采用比较严格的校正标准。

  1. 用REST自带的default mask ,P取0.001,cluster≥13即为经过Alphsim校正,即把cluster大于13的体素报出来作为结果吗?我通过看视频就是这样理解的,想请教老师这样理解对吗?

可以这样认为。虽然applied smoothness与effective smoothness会不太一致,更严格的操作需要对平滑程度进行估计。

Error | Forum of resting-state fMRI

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