关于alphasim的使用

各位前辈好!

      我现在做了一个两样本t检验,打算在rest里面使用alphasim来估计cluster size,首先需要估计平滑核,具体界面见附件。里面需要输入三个文件才能估计平滑核,其中中间的mask file是做两样本t检验的mask吗?那其余的input statistical map和 FWHM of statistical map需要输入什么呢?

      谢谢各位!

AttachmentSize
Image icon gunian18fei_1467520412040_21.png15.29 KB

建议挂载新一点的版本REST,参数设置见截图(默认参数,windows下的)。

其余的分别加入统计参数图(input statistical map)和目标mask(自定的,与统计参数图同样维度的),FWHM of statistical map使用上面的estimate来估算。

正好我也对这个AlphaSim的计算方法没有掌握到,看了你的回复还是不确定。

问题1:为什么这个FWHMY要在估算呢?不是我们在对这批数据进行预处理时选的平滑核的大小吗?

问题2:在点进Estimate后,input statistical map: 是选比如T检验的结果是吧?;Input Mask File,是选比如我做前面统计图用的REST自带的全脑的Mask,这里也选那个全脑的Mask吗?最后那个FWHM of statistical map选项是可以不用选留空吗?

怎么感觉估出来的不太对,我估出来是15.94了,最后算出来时需要400多个体素,这是怎么回事呢?

Error | Forum of resting-state fMRI

Error

The website encountered an unexpected error. Please try again later.