关于用Rest做相关

各位大侠, 请教一下,在用REST做相关分析时遇到的问题:

我首先计算了ROI在治疗前后分别和全脑的相关,然后我想用治疗前后做Paired—t test的结果的差值来和临床做相关,我本来打算把这个差值的脑区作成一个mask,用Rest算这个功能连接的变化和临床变化的相关,不知道这种方法对不对?如果用这个方法的话,Rest功能连接这个Add Group Images 的地方应该加入那组数据呢?

非常感谢!

帮您梳理一下问题:

我首先计算了ROI在治疗前后分别和全脑的相关,这里是指voxel-wise的功能连接吗

然后我想用治疗前后做Paired—t test的结果的差值来和临床做相关,这里在运行了paired t-tests之后,可能能定位出特定差异脑区,假定这里的差异脑区就是您的感兴趣区?

我本来打算把这个差值的脑区作成一个mask,这里不太清楚,这个差值(?)区域是上述paired t-tests之后的supra-thresholded cluster(s)吗?

用Rest算这个功能连接的变化和临床变化的相关,如果以paired t-tests 之后的supra-thresholded cluster(s)作为mask ROI是可行的,这些ROI可以应用在之后的group images相减的运算中(REST→utility→image calculator,然后对差值图像提取所有mask ROIs的数值),计算出每个被试在每个ROI内治疗前后的变化数值,REST会自动给出一个N(ROI 数目)× M(被试对数)矩阵。

不知道这种方法对不对?如果用这个方法的话,Rest功能连接这个Add Group Images 的地方应该加入那组数据呢?具体的过程参照上述描述。这里似乎不能一步完成,需要首先paired t-tests得到mask ROIs,接着对用于统计分析的两组zFC图像进行配对相减,然后再提取数值,最后与行为指标做相关,或者不用提取数值,直接在相减后的zFC图像上、ROIs范围内进行逐体素的相关分析(REST correlation).

非常感谢你的回复啊!不好意思我前几天没有上论坛看到:)

你上面说的那几点我都一一的做过了,跟你解答的一样,我目前有个疑问:

我们在用rest来save clusters的时候,保存下来的时没有mask的结果。所以当我做了t检验,比如找到10个结果,我只能逐个save cluster, 然后根据这10个存下来的mask,在计算相关的时候分别选择每个mask来进行吗?

那这样如果我做了10次相关,P值还是取0.05合适吗?还是需要矫正?

Error | Forum of resting-state fMRI

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