关于两种状态下的行为指标与ALFF/ReHo的相关分析 & xjview报道脑区

老师好,

   我做了一组被试(15人)在两种状态下(静息态和刺激态)的fMRI扫描,用paired t test做出两种状态的ALFF/ReHo差异脑区,然后提取差异脑区的ALFF/ReHo值,另外还测出每个被试分别在两种状态下的一个量表指标值(不算量表指标,是一个较客观的测试指标)。请问:

    (1)如果我要做这个指标值与差异脑区的ALFF/ReHo的相关性分析,以下三种方法哪种比较恰当:①只作刺激态下的指标值与刺激态下的ALFF/ReHo的相关分析;②分别作两种状态的指标值与ALFF/ReHo的相关分析,再进行对比;③把静息态和刺激态的数据串行放在一起(当作30人),再作指标值与ALFF/ReHo的相关分析?

    (2)我尝试只用了刺激态的指标值与刺激态的ReHo做全脑的相关分析,对R图卡0.7的阈值,cluster size 大于100,得出了这样的结果(如下图),这个结果属于相关效果比较明显吗?

    (3)做量表指标值与ALFF/ReHo的相关分析,一般直接做与全脑的相关分析还是差异脑区内的相关分析?

    (4)另外,在用xjview识别报道脑区的时候,会给出peak点的脑区信息,我经常会发现xjview给出的peak点所在的脑区信息(BA,AAL)与我利用BA AAL模板查看的不一样,请问哪个结果比较准确?

跪求老师的指导,谢谢!Orz

 

(1) 一定不能合并做(n=30)。我建议两处状态都做。一般不需要比较两种状态r值的差异。但如果一定要比较两种状态的r值的差异,也有一些方法,比如permutation t-test,或者将r转为z分之后直接相减,按标准z分布处理。

(2) r=0.7这个阈值已经是相当严格了。

(3) 你这种情况,我认为既可以在全脑做,也可以只在有差异的脑区做:有相关的脑区,未必一定在两处状态下有差异;而有差异的脑区,未必一定相关。

(4) 这个问题有点复杂,不知道有多大出入。我在这方面没什么经验。

您好,我最近在做三组被试的ALFF分析。我先做了ANOVA分析,找到了一些有显著性差异的脑区(ROI),接下来,我想计算ROI中的ALFF值,并在三组被试间进行两两比较的双样本T检验,比较它们之间的ALFF值,可是我不知道怎么提取ALFF值?我只能看到结果中的显著性值(t 值),但不知道怎么找ALFF值,请问怎么找到ALFF值啊?请求指点!!!

您好,我最近在做三组被试的ALFF分析。我先做了ANOVA分析,找到了一些有显著性差异的脑区(ROI),接下来,我想计算ROI中的ALFF值,并在三组被试间进行两两比较的双样本T检验,比较它们之间的ALFF值,可是我不知道怎么提取ALFF值?我只能看到结果中的显著性值(t 值),但不知道怎么找ALFF值,请问怎么找到ALFF值啊?请求指点!!!

大致可以分为三步:

1.保存ANOVA分析差异结果中每一个显著团块为一个单独的ROI,保存所有的团块/ROIs,使用save current cluster功能;

2.准备要提取ALFF值的数据对象,即用于统计分析的原始G1~G3的ALFF(zALFF),可以放在一个文件夹(要注意前缀命名容易识别)、或者三个单独的文件夹也行;

3.使用REST utility里面的extract ROI signals功能,将(2)中的数据文件夹放入数据框,将(1)中的ROIs定义为ROI就可以提取信号了~

老师,您好!我照着上述您的方法做,得到了如AD_mALFF_ResultCorr.txt,AD_mALFF_ResultCorr.mat,AD_mALFF_ROISignals.mat,AD_mALFF_ROISignals.txt文件,请问这些文件的含义分别是什么?我想最终做出类似下图(条形图)的结果,可是AD_mALFF_ROISignals.txt里有47个被试,就有47个数,是不是要对AD_mALFF_ROISignals.txt里数值做加权平均,这个均值作为AD组被试的ALFF值,aMCI、NC类似处理?