关于REST中用“SAVE CLUSTERS”功能保存的MASK的问题

严老师:您好
我发现用REST中用“SAVE CLUSTERS”功能保存的MASK,只有一对带灰度的img文件,不像用‘SAVE CLUSTER’功能会产生一对带灰度的MASK img文件,和一对二进制文件。我想问一下,用那个带灰度的img文件作为MASK进行统计合不合适。问这个问题的关键是我对SPM其内部识别MASK的条件标准不清楚,是只要voxel值大于0就认为是MASK,还是只有voxel值等于1才能认为其是MASK。请严老师多指教。

在REST中,只要不为0,就认可为MASK。
如果你一定要变成二进制文件,可以用Image Calculator,表达式为i1~=0

在REST中,只要不为0,就认可为MASK,这一点我明白了。另外,我想问一下在SPM中是不是也是默认这样呢,还是需要设置一下才能行。因为很多比较我是在SPM中做的,在其中用到MASK。多谢!

我印象中SPM也是如此,你拿两个MASK试验一下,看看结果是否一样?

那请问 save cluster 后出现的两个文件,在用来做Mask时应该选哪一个呢? 生成的两个文件分别有什么意义?

一般会生成两个文件,一个是binary mask,即二值化的,适合直接用来做mask;另外一个是包含intensity(例如包含统计参数的t,z,r等等)的cluster,也可以用来做mask,但用这个做mask,提取信号的时候,要注意选择提取cluster内的平均信号,不能再按照不同的数值分别提取信号。

Error | Forum of resting-state fMRI

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