FC用不用先做单样体T检验

严老师好,您在讲课视频中说:REHO, ALFF, fALFF在做双样本T检验前要先做单样体T检验。FC没有说做不做。我在文献中看到FC的文章,有人先做单样体T检验,后做双样本T检验;有人直接做双样本T检验。这是怎么回事??谢谢。

通常会做单样本T检验,来看各个组内的效应,通常也能给一个直观的印象。但注意,不能依靠单样本T检验进行推断,不能因为看到某脑区在A组显著,在B组不显著,就说A组比B组在该脑区活动更强。

另外,用两组单样本T检验显著的脑区,取并集成为mask,再做双样本T检验。有个朋友被审稿人说这样不妥,我仔细想想,也承认这样是有些问题的。
1. 这样你就看不到两组都不显著的脑区的差别。当然可以说这是因为不关心这样的区域。
2. 单样本显著做并集,意味着选出的脑区是 (1) 在A组显著但在B组不一定显著 (2)在A组不一定显著但在B组一定显著。这样,其实是将一些信息带入了双样本T检验的,从而减少了多重比较的次数。
因此,目前我还没想太好如何妥善的解决这个问题。而在功能连接中,假设报告r增加,其实隐藏中好几种情况:(1)正连接增加 (2)负连接减弱 (-5变成-1) (3)负连接变无 (4)负连接变正 (5)无连接变正。这种情况下,应该是需要把单样本T检验的信息引入。
如果一定要用单样本T检验创建mask,目前我能想的临时方案是:(1)仍然在全脑MASK内做多重比较校正(如果只关心灰质脑区的话,可以考虑用灰质MASK,以减少比较次数),做完多重比较校正之后,再与MASK相乘,只在MASK内看校正后的结果。(2)在双样本T检验时用更加严格的多重比较校正。并在文章注明这样的concern。但这样做有一定的风险。
欢迎大家就这样的问题进行讨论。

"用两组单样本T检验显著的脑区,取并集成为mask,再做双样本T检验"具体操作是不是在REST image Calculator并集?我做的是FC,
表达式是 (i1>0)+(i2>0)>0
还是 (i1≠0)+(i2≠0)>0
抑或是 (i1≠0)+(i2≠0)≠0
我做的是FC,正负连接都要看,什么样的表达式更适当呢?
另外看您视频中说“不等于是一个小波浪线”,具体是什么样子?
谢谢。

如i1,i2为t图
表达式应该为
(abs(i1)>thr)+(abs(i2)>thr)>0
thr为你单样本t检验的阈值
但是这样没有考虑到cluster size的校正。

你可先用sliceviewer卡阈值(双边)后存0-1图出来,
然后用
(i1>0)+(i2>0)>0

 是不是说在进行双样本T检验的时候MASK处留空啊?

此外一般会选用BrainMask,并进行校正。

校正后,可以再在单样本T检验MASK里面看。

Error | Forum of resting-state fMRI

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