March 2012

请教功能连接里关于回归的问题

您好!

询问

严老师
今天用REST统计算DARTEL分割的数据时出现以下错误,不知何意,请教,我的3GB大内存已经打开了。
wc2co20101205_150356t1mpr3Dsagp2isoXUDEZHENs003a1001.nii.img
wc2co20101205_160735t1mpr3Dsagp2isoFENGGUANGYUNs003a1001.nii.img
??? Error using ==> cat
Out of memory. Type HELP MEMORY for your options.

Error in ==> rest_ttest2cov_Image at 40
DependentVolume=cat(4,DependentVolume,AllVolume);

关于MASK,请教,十分感谢!

在你们的文章中写到:“The global mean ALFF value was calculated for each participant within a group GM mask obtained by selecting a threshold of 0.2 on the mean GM map of all 54 subjects. ”(Human Brain Mapping 2012)
想请问:这里的0.2是指什么值,这种设定MASK的做法是在MRIcro--ROI--Apply intensity filter to volume中做的吗?

该做法能否应用于设置WM MASK?

caret

老師,我在使用caret時,在load SCENE時,點選"Fiducial_Left"(無論任一選項)
皆會跑出,以下之文字,是因為我少安裝了什麼嗎

The following errors occurred while applying the scene:
Human.PALS_B12.RIGHT_AVG_B1-12.INFLATED.clean.73730.coord does not exist.
Human.PALS_B12.LEFT_AVG_B1-12.INFLATED.clean.73730.coord does not exist.Surface named "Human.PALS_B12.RIGHT_AVG_B1-12.INFLATED.clean.73730.coord" not found.

关于report

你好!
老师,对于最后做出的比如组间t检验图,我用xjview打开后,用report记录结果,但是只显示了脑区体素等相关信息,我需要相应的t值坐标等做结果,在哪里可以找到呢,或者进一步操作呢?
十分感谢!

询问

严老师好
最近我做DPARSFA处理数据
问题1:用normalized+Dartel是不是好于normalized by T1image by united segment

AlphaSim校正的问题

老师你好,我想请教的问题如下:
1. 为什么在脑的研究里,alphasim校正比FDR,FWE更合适?
2. alphasim校正时,选择不同的cluster size和p值结果会有明显的不同,我们如何知道选什么样的cluster size和p值才是合适的呢?选择p<0.001的脑区里却有着不属于p<0.005的脑区,我们如何解释这一现象呢?
3. 用alphasim校正时,我们在文章里除了报告p值外还要报告rmm的值和使用的mask吗?还有其他的吗?

非常感谢!

请教一个相关分析的问题

老师,您好!
参照REST的视频讲解,我先分别做了两组被试者的组内分析(within-group analysis),然后做了“并集”计算得出一个MASK,用于2-sample t-test。得到了两组间有差异的脑区。
我的问题是:如果我继续做correlation analysis(与行为量表相关),应该是把分析的范围限定在“并集MASK”内,还是限定在存在差异的脑区?那种做法会比较好?
另外,请问SPM可以直接做correlation analysis吗?

请问alphasim校正的问题

老师您好,
我用去除白质和脑脊液的mask做alphasim校正,算出来的结果两次不一样,0.05以下的cluster一次89一次90,为什么呢?而且全脑的不是85吗,为什么去除白质脑脊液后还变大了。请老师指教。

Individual analysis of REST

Hello all,