第一期 大脑功能及结构网络数据分析培训班

第一期 大脑功能及结构网络数据分析培训班

2019.06.26-2019.07.01 

主办单位:杭州拾睿科技有限公司

协办单位:杭州师范大学心理科学研究院

 

1.

培训简介

人脑是由约千亿个相互连接的神经元构成的复杂而庞大的网络,其任何一个认知功能的实现都需要多个脑区协同工作。磁共振作为一种安全无创的研究工具,已逐渐被广泛应用于神经、精神、消化、认知等医学和心理学领域,用于探索大脑发育、老化、情绪加工、运动障碍及记忆巩固等机制。通过分析磁共振影像数据,我们可以从不同角度去研究大脑结构及功能,并发表SCI文章。

为了让学员全面掌握大脑功能及结构网络数据分析技术并快速开展相应技术应用,我们的课程设计上不仅介绍理论,更注重实践操作。本次培训班特别邀请了静息态功能磁共振国内先驱臧玉峰教授讲解静息态功能磁共振方法,非常荣幸邀请到了BrainNet Viewer的编写者夏明睿博士、黄沛钰博士和季公俊博士讲解各种脑网络的分析指标。由RESTplus的开发者贾熙泽讲解数据分析预处理等操作。

培训班内容丰富充实,并配备充足的助教,希望通过此次培训,能帮助到广大临床医生及科研工作者熟练掌握脑影像数据处理技能,从而在研究道路越走越远。

 

2.

内容安排与特色

本期内容包括:

1)静息态功能磁共振数据预处理技术、基础统计以及作图

2) 多种功能磁共振数据分析指标,如:功能连接(Functional connectivity)、度中心度(Degree centrality)等方法

3)基于静息态fMRI的人脑功能连接网络构建

4)大脑功能网络拓扑指标计算、统计分析及结果呈现

5)大脑结构网络的构建与分析

6)脑网络时变分析方法及结果展示(dynamic ALFF/FC、聚类分析、circular等)

7)基于SnPM的非参数检验

8)采用PALM工具开展置换检验分析

 

本培训班课程设计重视数据分析上机操作,重点讲解软件使用及处理数据时常见问题,并提供丰富的例子数据,配备充足的助教,协助学员系统的掌握数据分析技术。参加培训的学员可以获得我们长期的技术服务和在线答疑。

本次培训班内容适合想系统学习脑网络数据分析的学员。

注:如果方便,请提前一天(2019625日,13:30 - 20:00)到会场安装软件、熟悉场地、拷贝资料等。

 

3. 课程安排

 

时间

课程名称

626

(周三)

臧玉峰

上午

l 静息态功能磁共振概论

l 功能磁共振数据分析整理流程解析

l 功能磁共振数据预处理

l 功能磁共振数据的质量控制

贾 熙 泽

贾 熙 泽

下午

l 基于种子点的功能连接计算

l Degree centrality计算

 

贾 熙 泽

晚上

l  单样本T检验

l  双样本T检验

l  配对样本T检验

l  结果查看与作图

627

(周四)

夏明睿

上午

l  基于静息态fMRI的人脑功能连接网络构建方法

l  上机(采用Gretna构建人脑功能连接网络)

下午

l  基于图论的复杂脑网络拓扑指标计算方法

l  上机(采用Gretna计算人脑网络拓扑指标)

628

(周五)

夏明睿

上午

l 脑网络拓扑指标的统计分析和结果呈现

l 上机(基于Gretna的脑网络拓扑指标结果进行分析和绘图)

下午

l 脑网络可视化软件BrainNet Viewer详解

l 上机(采用BrainNet Viewer进行脑网络分析结果呈现)

629

(周六)

季公俊

上午

l 时变分析的基本概念和方法(基于滑动窗的dynamic ALFF/FC计算练习)

l 上机操作

下午

l 时变分析的基本概念和方法(基于FLSdynamic ALFF/FC计算练习)

l 上机操作

630

(周日)

黄沛钰

上午

l脑结构网络研究介绍

l使用CAT12软件进行灰质属性提取

l脑结构网络的构建与分析

下午

l 影像学置换检验统计分析介绍

l 采用PALM工具开展置换检验分析

71

(周一)

季公俊

上午

l 脑网络时变分析和结果展示(聚类分析、circular

l 上机操作

下午

l非参数检验基本概念和方法(基于SnPM的统计练习)

l上机操作

备注:请各位学员自带笔记本电脑,建议电脑配置:windows 64位系统、4G以上内存、40G以上剩余硬盘空间

 

4. 授课老师

臧玉峰:医学博士。杭州师范大学心理科学研究院执行院长。1984于年河北医学院获医学学士学位、1991年于天津医学院获神经外科学硕士学位、2002年于北京大学精神卫生研究所获儿童精神卫生博士学位。曾经从事临床神经外科工作14年,之后在中科院自动化所模式识别国家重点实验室、北京师范大学认知神经科学与学习国家重点实验室以及杭州师范大学工作。近年来主要从事静息态功能磁共振影像的计算方法学及其在认知与脑疾病的应用研究。与同事提出“局一致性”和“低频振幅”等方法。带领研究团队开发了RESTDPARSFRESTplus等软件。合作发表英语论文100多篇,Google Scholar数据库引用21319次(h指数64)。20142018年连续5年入选Elsevier“中国高被引学者”(神经科学),20172018年入选Clarivate 高被引学者(神经与行为科学)。

 

夏明睿:博士,北京师范大学认知神经科学与学习国家重点实验室副研究员。从事多模态脑影像连接组大数据的计算方法、高性能计算和可视化软件平台开发及其在重大神经精神疾病中的应用研究。主持国自然面上项目和青年项目,作为研究骨干参加国家自然科学基金重大研究计划、科技部863、北京市脑计划等10余项国家和省部级课题。在本领域共发表SCI论文50篇(含接收),其中以第一作者或者通讯作者在Schizophr BullCereb CortexNeuroimageHum Brain Mapp等主流学术期刊发表论文29篇,1篇入选ESI Top 1%高被引论文,论文Google Scholar总引用3389次,SCI总引用2349次,单篇最高SCI引用800次。获批软件著作权两项。获2014年度北京市科学技术奖二等奖。担任国家自然科学基金、英国生物技术与生物科学研究理事会(BBSRC)基金评审专家,NeuroImageHum Brain MappTranslational Psychiatry等二十余个国际期刊审稿人。开发的脑网络可视化软件BrainNet Viewer下载量达29,600余次,被包括哈佛大学、牛津大学等1000多个国内外实验室所采用发表SCI论文1200余篇,其中包括发表在Nat Rev NeurosciLancet NeurolJAMA OncolNeuronLancet PsychiatryMol PsychiatryBrainPNAS等国际顶级期刊上的论文,每两天即有一篇采用本软件的SCI论文发表。

 

季公俊:博士,安徽医科大学医学心理学系,副教授,硕士生导师。2013年,于北京师范大学获得认知神经科学博士学位(导师,臧玉峰教授)。主要研究兴趣为:多模态神经影像协助下的临床干预治疗;大脑双半球的工作机制;脑白质BOLD信号的生理意义。自2013年至今,以(并列)第一或通讯作者先后在Schizophrenia bulletinRadiologyHuman Brain MappingNeuroImage等杂志发表SCI论文16篇(JCR一区7篇)。获国家自然基金和博士后基金各一项。近两年围绕rTMS开展系列工作,独立开发TMS靶点定位软件TMStarget(获得国家软件著作权),申请三项TMS相关国家专利,致力于提高rTMS的治疗效果,推动其临床应用。

 

黄沛钰:博士,高级工程师,浙江大学硕士研究生导师,主要从事多模态神经影像研究。曾主持2项国家自然科学基金,1项浙江省自然科学基金重点项目,以骨干成员身份参与2十三五国家重点研发计划项目以及十余项国家省部级课题,发表SCI论文60余篇,获得浙江省科技进步二等奖1项。担任浙江省生物医学工程学会放射学青年委员会副主任委员,中华医学会放射学分会磁共振学组Youth Club成员,是国家自然科学基金评审专家、浙江省科技厅项目评审专家。

 

贾熙泽:杭州师范大学客座助理研究员,杭州拾睿科技有限公司创始人。臧玉峰教授课题组成员,具有计算机、心理学及神经科学交叉背景。具有6年的磁共振数据分析经验,脑科学数据分析代码量超过10万行,RESTplus软件的主要开发人。近年来负责静息态功能磁共振论坛(http://www.restfmri.net)网站维护以及答疑工作。主要研究方向为静息态功能磁共振方法学、数据分析软件开发。合作发表多篇SCI文章,曾多次受邀在国内外重要学术会议介绍静息态磁共振数据分析,其中包括:Fifth Biennial Conference on Resting State / Brain Connectivity (Vienna) 等。

 

 

5. 培训人数

培训班小班授课,手把手教数据分析,人数28人左右,报满截止。为方便会务安排,报名敬请从速。

 

6. 培训费用

每人3500元,包括培训费、资料费;交通及住宿费用自理。本培训班开具可以报销的正式发票。不支持现场缴费,培训期间谢绝录像。可以银行卡转账或支付宝付款,支付宝账号:jiaxize@foxmail.com,杭州拾睿科技有限公司

 

7. 培训地点

培训地点:杭州师范大学仓前校区,城研中心(浙江省杭州市余杭区仓前街道余杭塘路2318号),具体见会议指南。

 

8. 报名方式

请将报名回执以及缴费回执发送至srbrain@126.com,我们会联系您。

 

9. 联系方式

联系人:张涛

电话:199 4136 3069(微信同号)

报名回执表

单位名称(发票抬头,纳税人识别号)

 

发票类型(请打√)

()培训费

()会议费

()不需要发票

姓名

 

性别

 

电话号码

 

微信

 

科室/专业

 

研究方向

 

银行信息

户名:杭州拾睿科技有限公司

账号:3301040160010744277

开户行:杭州银行官巷口支行

汇款备注

1期 大脑功能及结构网络数据分析培训班

 

10. 在线支持服务

   拾睿科技将为参加培训的学员提供免费的在线支持以及合作服务,确保学员能够熟练掌握脑影像数据处理的相关方法。

老师们好,
想请教下,如何求AAL模板中所有regions两两间的功能连接矩阵?
1. 我之前听到gretna好像可以构建图论网络,如果我不是做图论的各种degree等的指标,只关注所有这些regions之间的两两连接,可以用gretna实现吗?这个同用gretna做图论分析有哪些需要注意的吗?
2. rest求FC可以实现吗?因为我之前没有用过gretna,如何可以用rest实现就最好了。

祝好,
Icey

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