请教如何计算各脑区的体积和密度信息

论坛版主:
你们好!
不好意思,打扰你们了,我想请教各位一个如何提取各个脑区的体积信息。结构的数据我已经有了,用VBM处理过数据,但我感兴趣的是每个脑区体积的信息,而不是总体灰质或白质的情况,比如我想提取AAL模板中第58个脑区的体积数据

,不知道有没能软件能实现这个功能。
谢谢!!

REST->Utilities->Extract ROI signals。
视频里面有介绍。

谢谢你的回答
我还有个疑问,rest中Extract ROI signals功能是根据你MASK里的体素按均值提取出来的吧。但我如果要提取第52个脑区的体积时,我提取的应该不是这个脑区MASK里体素的一个均值,而是一个第52个脑区里所有体素的一个求和吧,如何解决这一问题呢?
打扰了,抱歉!

谢谢你的回答
我还有个疑问,rest中Extract ROI signals功能是根据你MASK里的体素按均值提取出来的吧。但我如果要提取第52个脑区的体积时,我提取的应该不是这个脑区MASK里体素的一个均值,而是一个第52个脑区里所有体素的一个求和吧,如何解决这一问题呢?
打扰了,抱歉!

鉴于你的需要,你应该是用REST Extract ROI Signals中"Multiple label values in a single mask"选项,才能一下提取多个AAL脑区的值。
如果是这种情况,打开rest_ExtractROITC_MultiValues.m,将第53行从
theROITimeCourses(t) =mean(theTimePoint);
改为
theROITimeCourses(t) =sum(theTimePoint);

即可。

老师好,想请问下如何利用REST Extract ROI Signals中"Multiple label values in a single mask"一下提取多个AAL脑区的值呢?REST Extract ROI Signals中的ROI怎么定义呢?怎么建立label呢?我点进去看见有AAL模板的选项,可是他需要在AAL模板中挑选。可我需要的是直接把AAL模板中几十个脑区的值分别提出来,期待老师的回复。

老师好,想请问下如何利用REST Extract ROI Signals中"Multiple label values in a single mask"一下提取多个AAL脑区的值呢?REST Extract ROI Signals中的ROI怎么定义呢?怎么建立label呢?我点进去看见有AAL模板的选项,可是他需要在AAL模板中挑选。可我需要的是直接把AAL模板中几十个脑区的值分别提出来,期待老师的回复。

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