Resting-state fMRI topics

关于MASK,请教,十分感谢!

在你们的文章中写到:“The global mean ALFF value was calculated for each participant within a group GM mask obtained by selecting a threshold of 0.2 on the mean GM map of all 54 subjects. ”(Human Brain Mapping 2012)
想请问:这里的0.2是指什么值,这种设定MASK的做法是在MRIcro--ROI--Apply intensity filter to volume中做的吗?

该做法能否应用于设置WM MASK?

caret

老師,我在使用caret時,在load SCENE時,點選"Fiducial_Left"(無論任一選項)
皆會跑出,以下之文字,是因為我少安裝了什麼嗎

The following errors occurred while applying the scene:
Human.PALS_B12.RIGHT_AVG_B1-12.INFLATED.clean.73730.coord does not exist.
Human.PALS_B12.LEFT_AVG_B1-12.INFLATED.clean.73730.coord does not exist.Surface named "Human.PALS_B12.RIGHT_AVG_B1-12.INFLATED.clean.73730.coord" not found.

请教一个相关分析的问题

老师,您好!
参照REST的视频讲解,我先分别做了两组被试者的组内分析(within-group analysis),然后做了“并集”计算得出一个MASK,用于2-sample t-test。得到了两组间有差异的脑区。
我的问题是:如果我继续做correlation analysis(与行为量表相关),应该是把分析的范围限定在“并集MASK”内,还是限定在存在差异的脑区?那种做法会比较好?
另外,请问SPM可以直接做correlation analysis吗?

请问在Rest软件包中提供的mask为什么要卡阈值

老师:
在Rest软件包中提供的全脑、白质和CSF的mask都卡了阈值,请问为什么要卡阈值,以及为什么卡的阈值分别为50%,90%和70%,请问有什么依据吗?卡过不同阈值的mask之间加减运算有意义吗?
如果要做一个灰质mask,是否可以用rest软件包中的“BrainMask_05_61x73x61”-“CsfMask_07_61x73x61”-“WhiteMask_09_61x73x61”得到?得到的结果是卡过多少阈值的灰质mask呢? 谢谢