Resting-state fMRI topics

Reho ，功能连接的一些问题

Submitted by swy1017 on Fri, 03/04/2011 - 12:45

严老师，您好，我是湖南中医药大学的一名研究生，我们选择了一些正常受试者做了静息态的脑功能连接，分为4个状态，即静息态，静留针态，电针刺激态，拔针后效应态。已经经过初步处理得到了一些数据，结果有10个受试者的数据符合要求，我想请教您几个问题，好吗？
（1） 我想看单个受试者在每个不同状态的激活图像也是用rest slice viewer看吗？我打开后，得到的图像如下：

p值还需要设定吗？为何结果看起来满脑都是激活点，我发现通过移动Threshold可以让激活点改变，但为何p值总为1，不能更改吗？那我应该如何确定Threshold值呢？
（2）我用dparsf做的功能连接，软件已其经Fisher转化为了Z值，那我应该如何看到存在功能连接的每个脑区的平均Z值结果呢？

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有关功能连接中的负相关

Submitted by junperson on Wed, 03/02/2011 - 11:29

亲爱的老师，您好！

我不太理解功能连接中的负相关说明了什么。

1) 导致负相关的可能原因有哪些？是生理原因？还是数据处理方面的原因？较高的正相关和较高的负相关，在生理意义上有什么差别？

2) 做双样本T检验之前，是否可能会需要将每个被试的功能连接结果做一下绝对值化(abs)，然后再进行组间比较？

盼复。非常感谢！

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ALFF value for patients with brain lesion

Submitted by vivi on Wed, 03/02/2011 - 07:08

老师们好，

我在使用ALFF的时候有一个困惑，感觉ALFF是大脑在rest状态下自发活动的一个指标，那是不是从理论上面来说，对于有明显脑损伤的病人，如中风，切除等，在他们lesion的地方ALFF值应该是相对低的呢，因为这些地方没有neuron活动？

谢谢！

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bandpass filter in REST toolbox

Submitted by hldeepblue on Tue, 02/22/2011 - 20:15

超赣你好！ 谢谢回复！

我用的是Vista系统，matlab 7.1 R14，REST的版本为REST_V1.4_100426，刚刚使用rest_Fix_Read_Write_Error，但是错误仍然出现，请指教！

错误信息如下：

>> rest_bandpass('C:\Program Files\MATLAB71\work\FunImgNormalizedSmoothed\sub1', 3, 0.08, 0.009, 'No', 'C:\Program Files\MATLAB71\work\Masks\mask001.img');

Ideal rectangular filter: "C:\Program Files\MATLAB71\work\FunImgNormalizedSmoothed\sub1"

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