Resting-state fMRI topics

各位老师好，我在制图的时候遇到以下几个问题，想请教一下各位老师，非常感谢！

1、我们知道AAL模板有90个区域，我计算了每个区域的某个属性值，比如说中央度，我计算出了中央度最大的5个区后，在rest的Slice View里把这5个区Save Clusters了，得到了一个.img和一个.hdr文件。可是在显示这个文件的时候，颜色是按这5个区的Labal值显示的。如果我希望这5个区域的颜色显示的是我计算出来的中央度，需要怎么做？

2、我把正常人中央度显著大于AD患者的区域做了一个图，又把AD患者中央度显著大于正常人的区域做了一张图，怎么把这两张图叠加在一起，并且使AD>Nor的显示红色，Nor>AD的显示蓝色？

大家好！请问regressor这个词应该怎么理解啊？我最近在很多地方都看到这个词，请大家不吝赐教。
在SPM8的manual里第62页讲到1st level analysis的Timing parameters设置时，提到“Also, with long TRs you may want to shift the regressors so that they are aligned to a particular slice. This is eected by changing the microtime resolution and onset.”

第63页的fig8.2也提到了这个词，图如下：

老师，您好
用Rest做fC,我遇到坐标问题，得出的结果图像与原始图像以及mask不一致（x坐标上有位移，并且x轴上的起始坐标不一致）。
如下：
restFMRI_1 是处理好的fmri数据。我用rest做ROI Center(mm)=(-5.500000e+00, -31, 1.150000e+01); Radius=1.50 mm， 与全脑的功能连接
mask 全脑的mask
FCMaps_result 得到的结果。

可以看到，restFMRI_1 和 mask 的坐标以及原点是一致的，可是得到的FCMaps在x坐标上有位移，并且x轴上的起始坐标不一致。
这是怎么导致的，有没有办法解决。

另外，对于我定义的ROI，Rest在计算时，会不会四舍五入，把ROI变成 (-6,-31,12); R=2mm ???

各位老师，新年快乐。

对于rest统计我有一个疑问：

假设我有10个被试，每个被试有6个session的resting fmri，每个session是5分钟的扫描。
现在我用PCC做ROI与全脑做功能连接，于是就会得到 10个被试*6个session = 60个 zFCMaps.

现在我想看PCC与哪些区域有显著的功能连接，我是不是可以直接拿这60个zFCMaps做one sample t test?

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但是我看一些文献，好像在统计做了区分（不知道我理解对不对）：
fix-effect -- 由每个人的6个session的zFCMaps来得到每个人的map， 这样60个zFCMaps就变成了10个maps ????这个过程不需要由样本推测总体？？
mix-effect -- 由每个人的maps得到总体的maps，这样10个maps就变成了我想要的一个map ??? 这个过程是由样本推测总体 ，所以在统计时的一些参数和上面不一样？？

这个概念我一直不是很清楚，我一直就是用rest的one sample t test来处理，没分什么fix-effect和mix-effect。

严老师：
       您好。我根据您的视频做了三个正常人的REHO及ALFF，顺便试着做了个单样本t检验，得出的图像出现了蓝色的激活区，而且在脑室里也有激活的存在。现在的问题是1、为什么会出现负激活，这个要怎么解释？2、脑室出现激活，是因为我的病例数太少，统计学误差还是因为在数据处理过程中有问题？谢谢您。

The REST toolbox is coded as follows;
" Covariables Polort (Polynomial Orthogonal Degree): 0 "

Is it right? I think this code can't regress out covariables because '0' means not to use this function.

Please comments.

What number is right for covariables polort?

严老师您好：
      先前咨询您答复说rest可以用于7.0t 大鼠的脑静息态数据的分析。 我们大鼠的模板是由中科院高能物理所开发的，他们认为用rest分析鼠脑的数据要做一定的修改。因为为医学背景，比较困惑。能不能简单告之原因？谢谢。

严老师：
      你好，我在用Spherical ROI来做感兴趣的时候，用view ROI来看我的种子点的时候，选取了ch2模板，但是matlab提示出现问题以下问题，而且我直接做FC的时候也出现了这个问题。请问怎么样解决？
Exception occured. (MATLAB:COPYFILE:OSError)
 Error using ==> copyfile
另一个程序正在使用此文件，进程无法访问。

 I want to do some research with 7.0t mri. Whether I can complete the analysis of bold signal with the software REST? I have Rat template now.