Resting-state fMRI topics

老师，您好。最近的一篇文献
Network Modelling Methods for FMRI, Smith et al.对功能网络的各类方法进行了评价。其中提到了Full correlation 和 Partial correlation。REST所计算出来的应该是Full correlation吧？

严老师：请问在SPM中如何将.nii格式的数据转化为.mat格式的数据啊

我已经用one sample test做出一组病人的脑功能连接图，在做完多重比较检验以后，我用rest slice viewer的cl.report得出clusters的坐标和大小，现在假如我关注其中一个clusters有兴趣，想了解这组病人里面每个人在cluster相应的位置的cluster大小，我用rest slice viewer打开每个被试的FCmap，但是里面的threshold（也就是correlation coefficent）我应该怎么样设置比较合理？
因为设置的值不同，会使得cluster也不同，这里设置的值需要和我前面做多重比较检验检验的值联系起来吗？（P<0.005 FWHM=4）

老师：
    您好。
    我看了您的教程。用Rest做one sample t-test ，如果是m*-1的文件就和0比，m*就和1比。
   那么，对于功能连接的zFCmap,要和0比还是和1比呢?

老师：
     您好。
     我用rest slice view看我的功能连接的结果，用了ch的underlay。但是发现ch的dimension和voxel size和我的功能像不匹配。
    然后我就想对ch.nii用rest进新reslice，但是好像rest只能处理img文件，不能出来nii文件。
    是不是我需要把我的功能结果reslice到和ch.nii一样？

请教一下，我用sliceviewer的时候，t值color bar的值会随着数据改变上下限，如何设置统一的上下限，可以使多个结果之间的color bar统一？
如图所示。
我试着设置了range of threshold，但是没有作用。求教，谢谢！

老师，您好。
    

Warning: There are too few time points.(i.e. The number of the time points is less than 10)

我做了某个ROI的voxel-vised的功能连接，得到zFCMAP，我对2组人的zFCMAP进行two-sample test，然后就出现了以上的Warning. zFCMAP好像不存在时间点这个概念吧。在算功能连接时，不是所有的时间序列的值都平均成一个值了么。

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    Image Files in Group 1:
    zFCMap_lFFA_AD01_detrend_filtered_Covheadremoved.img
    zFCMap_lFFA_AD02_detrend_filtered_Covheadremoved.img

  老师们好：
  我们使用GE的机子扫描患者BOLD相，扫描240个时间点，33层一共应该有7920幅图像，但是有几个病人导出数据后只有7919幅图，这样能不能进行后序静息态数据处理呢，我用DPARSF跑这样的数据一跑一个错，有没有什么办法能够解决这个问题呢？
报错为：Converting 7919/7919  240
1.2.840.113619.2.244.6945.3202482.22429.1278821188.824.dcm->20100711_143045EPILEPSYF5RENQIANGs004a1001.img
Time elapsed 47594ms
Converting Functional Images:Sub_001 OK
??? Index exceeds matrix dimensions.

Error in ==> DPARSF_run at 274
            delete(DirImg(j).name);