Resting-state fMRI topics

[DPARSF]extract AAL90 time series for making fc matrix

Submitted by YHC on Thu, 10/30/2014 - 15:44

 各位同學老師好，

有一個問題想要請教大家，我利用DPARSF etract ROI TC時會產生一個ROITC的new folder看網路上可以將其中的ROICorrelation_FisherZ.mat (node數xnode數)，可以作為放進NBS裡分析的data。我想要做一個AAL90一樣的fc matrix，但是extract ROI TC時得到的是90x(200x1)[AAL90x時間點]的mat檔，而不會得到FisherZ.mat，想請問我要如何將這樣的data做成或轉換成90x90的matrix呢？麻煩大家給我建議了，非常感謝！

Forums: 
Resting-state fMRI topics

PDARSF不读取数据，怎么办？

Submitted by lipingchxyy on Wed, 10/29/2014 - 04:17
 各位老师大家好：
我在用DPARSF处理数据时，participants中总不能提取数据，不知是什么原因。重新在set path中安装DPARSF软件也不好使。把被试的功能像放在一个FunRaw的文件中了。
我用的是软件分别是D:\matlab\R2010b，REST1.8和DPABI1.1
原始文件是IMA格式，是否需要转化成DICOM格式的呢？若需要，怎么转化呢？
记忆中，DPARSF直接能提取IMA格式的文件。
期待各位老师的答复！
祝好！
Forums: 
Resting-state fMRI topics

AAL 90 and other atlases ROI time courses in demonstrational data

Submitted by sivaselvik on Sun, 10/26/2014 - 15:27

Dear all

I find ALFF, ReHo and other results but I dont find any ROI time courses of various atlases like AAL 90, Craddock atlas, Harvard-Oxford atlas etc in the demo results provided in the website. It will be very helpful to verify our results if ROI time course results are provided in demo data.

Forums: 
Resting-state fMRI topics

请教关于功能连接的问题

Submitted by Carolineqiu on Sat, 10/25/2014 - 23:01

      各位老师好，我现在初步接触到FC，遇到几个问题想请教一下。
      （1）我现在已经得到了以楔前叶为种子点的zFC图像（.nii）,如果想求每个被试者全脑的zFC值，应该怎么提取呢？
      （2）另外得出zFC值以后，是否可以比较两组的全脑连接差异，再提取差异脑区的zFC值与临床变量做相关呢？
       期待各位老师的解答，谢谢！

Forums: 
Resting-state fMRI topics

关于重采样问题

Submitted by benchenchen on Wed, 10/22/2014 - 10:35

各位老师好，
      我想咨询一个关于rsfMRI重采样的问题，我们的数据采集的时候层厚是5mm，间距1mm,所以图像体素就大了点，3.44*3.44*6,重采样是就根据大家常用的3*3*3了，这种程度的重采样不懂能不能被接受？？还是我应该用多大的重采样的体素大小好呢？有没有相关的参考文献指导重采样问题呢，谢谢。

Forums: 
Resting-state fMRI topics

关于动态FC及rsfMRI预处理的重采样问题

Submitted by benchenchen on Mon, 10/20/2014 - 16:49

      各位老师好,投了篇关于rsfMRI的文章，内容是计算FC及其与行为学相关，审稿人问了两个问题，不知该如何回答，希望各位老师提点点子，或者有什么参考文献可循么？万分感谢！问题如下：
      

Forums: 
Resting-state fMRI topics