Resting-state fMRI topics

AlphaSim矫正咨询

各位老师好:
        我数据预处理的平滑是6mm,做完双样本T检验后,想使用AlphaSim矫正,首先利用REST软件进行平滑估计,统计图输入双样本T图,MASK选用的是一个灰质MASK(使用SPM自带的灰质模板卡了个0.3的阈值),估计出来的平滑总是很大(ReHo、alff、VBM的结果差不多都是这样)。。。这可能是什么原因造成的呢?

differences between images before and after covariates regression

老师,

您(们)好!

很想问问在 regress out 那些 covariates 后,为什么影像,无论脑内脑外都变化很大呢?比如,脑内外边缘开始变得不太清晰等等。

这些 residuals 应该是我们希望保留的。但很想明白为什么。

非常感谢!

关于使用DPARSF的几个问题。

各位老师们好,我在使用DPARSF过程中 有以下几个地方不明白,希望老师们能帮我解惑。
问题1,我在预处理时没有勾选 Extracting ROI time courses这几项,可是计算完fALFF后该Regress out nuisance covariates 时 就总报下列错误:(DPARSF设置如附件1所示)
 Read 3D EPI functional images: "E:\Analysis\FunImgNormalizedSmoothedDetrendedFiltered\Sub_001".

Question: how to create ROI mask for functional connectivity?

Hi,

I am Grace. I am a beginner of the resting-fMRI analysis.
I want to use a user-defined ROI for a functional connectivity analysis.

I am wondering if you could tell me how to create ROI images with the MNI template using the REST gui step-by-step. 

DPARSF进行预处理 到滤波时的问题。

老师们好,用DPARSF处理数据到滤波时总报错,报错内容如下:
Removing the linear trend: E:
  Read 3D EPI functional images: "E:\DPARSF\Analysis\FunImgNormalizedSmoothed\Sub_001".......................................

  Detrend working. Wait.............

  Saving detrended images. Wait...
  Detrend over.
 Elapsed time is 24.863510 seconds.
Moving Dtrended Files:Sub_001 OK

新手 关于使用DPARSF进行数据转换的问题

老师们好,我刚刚开始接触这个领域,所以所问问题比较浅显,你们的任何一句话对我来说都是醍醐灌顶。
我的DICOM数据属于MRIcroN的dcm2niigui 可以成功转换成NII文件,可是在DPARSF就总显示出错。
出错的内容如下:

Chris Rorden's dcm2nii :: 1 April 2010
reading preferences file D:\DPARSF_V2.0_110505\dcm2nii\dcm2nii.ini
reading preferences file DCM2NII.INI
Validating 16 potential DICOM images.
Found 16 DICOM images.

新手 关于使用DPARSF进行数据转换的问题

老师们好,我刚刚开始接触这个领域,所以所问问题比较浅显,你们的任何一句话对我来说都是醍醐灌顶。
我的DICOM数据属于MRIcroN的dcm2niigui 可以成功转换成NII文件,可是在DPARSF就总显示出错。
出错的内容如下:

Chris Rorden's dcm2nii :: 1 April 2010
reading preferences file D:\DPARSF_V2.0_110505\dcm2nii\dcm2nii.ini
reading preferences file DCM2NII.INI
Validating 16 potential DICOM images.
Found 16 DICOM images.