Resting-state fMRI topics

删除中间文件

 大家好。

用DPARSFAu预处理后,会生成很多中间文件。当被试很多的时候,太占硬盘空间。

对于功能像,每一步产生的文件都好理解,很容易删除不必要的中间文件。

对于结构像,有以下2个问题:

1. T1ImgCoreg,这个文件夹是否可以删除,而不影响后续 的处理?

2. T1ImgNewSegment , 里面有很多文件,哪些可以删除,而不影响后续的配准:

BiasField_T1.nii
c1T1.nii
c2T1.nii
c3T1.nii
c4T1.nii

删除中间文件

 大家好。

用DPARSFAu预处理后,会生成很多中间文件。当被试很多的时候,太占硬盘空间。

对于功能像,每一步产生的文件都好理解,很容易删除不必要的中间文件。

对于结构像,有以下2个问题:

1. T1ImgCoreg,这个文件夹是否可以删除,而不影响后续 的处理?

2. T1ImgNewSegment , 里面有很多文件,哪些可以删除,而不影响后续的配准:

BiasField_T1.nii
c1T1.nii
c2T1.nii
c3T1.nii
c4T1.nii

怎么利用这些ROI Signals呢?

 各位老师好:
      我用MICA提取了实验组的DMN网络(选择了Z-score转换),然后利用REST的extract ROI signals工具(感兴趣区选择为PCC/PC)提取的txt文件内容代表这个网络在这个ROI上的功能连接值,也是Z-value,理解的对吗?

REST激活图左是右,右是左的问题

 请教老师,论坛上的视频中提到slice viewer中打开的overlay是NIFTI格式时,左是右,右是左。严超赣老师示范了从slice viewer保存图像并用ps处理的过程。这样得到的tif图片就可以直接用于投稿了吗?不管左右相反的问题吗?

orientation of after DPARSFA - no ANOVA with spm8 possible

Dear all, I run DPARSFA to obtain ALFF data. I used the results (zALFF) as input in SPM8 for two way ANOVA (full factorial analysis 2nd level). I got the following error: (see below). It says orientation is not the same, but I double checked and it is ras for all subjects. Anyone who has an idea what is causing the problem and has a solution? Thanks a lot!

生成Reho, degree centrality, fALFF,ALFF先后次序

 I will type in English this time and hopefully it is readable...

1) In the preprocessing, rigid-body6 is the default one. Would Friston24 be a better choice?

2) My impression is that Reho and degree centrality can not be derived from smoothed data and therefore they have to be dealt separately. In calculating Reho and degree centrality, should I unselect the smooth, unselect the fALFF+ALFF, but keep Filter selected, before I choose the ReHo, smooth ReHo, and Degree Centrality (see fig attached)?