Resting-state fMRI topics

Does ReHo read .nii files as input files instead of .hdr/.img files?

 各位老师，
     请问同一批数据，相同预处理条件，都做了空间标准化之后每个被试的head文件是不是除了文件名之外其他都是一样的啊？我想计算一组人的ICC但不知道怎么把算完的结果再写成nifti格式文件，不知道用哪个head文件比较好，我考虑要是head内容都一样的话是不是可以随便选一个？请老师教我。

 老师：
       您好！谢谢您百忙之中的作答！
       对于GCA的方向性连接，我已经对已知脑区得出了结论，但在其结果呈现上遇到了困难，我想将其激活脑区在大脑三维图上呈现，但xjview无法针对GCA的txt文件进行读取和展示，不知道有没有其他软件可以根据我想展示的激活脑区而生成的大脑三维图软件？
       十分期待您的回答！

thank you so much for the great tool!!!!

i really appreciate your effort!!

while using DPARSF_V2.3_130615

error occured

it says

Undefined function 'rest_ReadNiftiImage' for input arguments of type 'char'.

Error in y_FD_Jenkinson (line 31)
[RefData, RefHead] = rest_ReadNiftiImage(ReferenceImage,1);

Error in DPARSFA_run (line 858)
FD_Jenkinson = y_FD_Jenkinson(rpname.name,RefFile);

Error in DPARSFA>pushbuttonRun_Callback (line 1601)
[Error]=DPARSFA_run(handles.Cfg);

老师们好，
我现在有两组年龄相差较为显著的数据，想去除这个年龄的协变量。我知道在two-sample t-test的时候可以加入txt去除协变量，如果我做功能连接呢？在功能连接之前如何可以去除这两组的年龄协变量？DPARSF只可以加入图像的协变量，而REST我注意到是一次只能加一个，怎样可以同时加入这两组的年龄txt去除协变量？烦请老师们解答下，谢谢。

老师：
       我想问rest主流是做静息态，但是是否可以做结构像的后续处理呢？比如双侧t检验，并提取平均值？

请教老师采用怎样的预处理或方法能够使静息态的功能连接的结果只有正值没有负值呢，我试了不去除全脑平均协变量，还是有负值。如果两个脑区的连接值是负值，那负值的绝对值越大，能说明功能连接越小么，谢谢老师！
还有gca的基于系数的结果有正有负，负的是说明抑制么，从-1变成-2是说明抑制作用增加么，谢谢老师！

各位老师，在下的问题如题目中所言：
关于AlphaSim校正所用的FWHM到底该用预处理时的平滑核还是用SPM生成的统计图（con .img/spmT .img）估计出的平滑核?
在下处理任务态fMRI的结果时，如果用预处理的平滑核FWHM=8，则结果有较多激活。
但若用REST的AlphaSim软件估计出的平滑核，则要大很多（且此值和SPM生成的全脑报表中的FWHM大小一致，17.5，17.2，17.2），如果按此值来做校正，则无显著激活存留。
在下翻遍了之前此论坛的帖子，未发现有明确说明此问题或给出明确答案的帖子。到底该用哪个平滑核呢？？？？？
在下疑惑万分，心急如焚，还请各位老师不吝赐教！

事件相关设计，是不是模仿静息态，将事件前时间点文件放在一个文件夹，事件后时间点文件放在另一个文件夹，相当于转化为观察组和对照组数据？
这样统计分析也可以用rest完成？

 我用reho做出两组的差异区，然后用差异区作为种子点进行全脑功能连接，算是循环分析吗？谢谢！