Resting-state fMRI topics

老师，您好，我现在刚接触数据处理，正在做ALFF分析，过程中遇到了一下几个问题，想请教一下：
1.单样本T检验中及双样本T检验中MASK怎么制作啊？我看到http://restfmri.net/forum/node/1040中说“ 制作MASK有个虽然笨但肯定不出错的方法告诉你,save clusters,然后在calculator里自己除以自己,即i1./i1,两幅单样本图都这样处理,相加之后再除以自己”：这个表达式具体怎么写啊？
2.我看到视频中单样本及双样本t检验是对mALFF及 mfALFF进行分析，主要是看这两个结果吗？
3.在Viewer中P值选择0.005、0.01、0.05，这个依据什么选择呢？

老师您好，
      我用DPARSF 2.1进行数据预处理，刚开始做Slice Timing就出现错误，小白表示看不懂，求指教，非常感谢。
      PS：用的SPM5和REST_V1.8

错误如下：

Running "Slice Timing"

 老师，

 您们好！
 
 我下载了AAL 116 roi center 的坐标。但使用一个软件看点分布的时候，发现只有一个大脑半球显示了AAL 的 ROIs。下载craddock坐标后，这个软件显示的是全脑node分布。很想问问使用AAL roi 中心坐标的时候是否需要注意些什么。。。？

 非常感谢！

Hi REST experts,

I'd like to perform Degree Centrality analysis within restricted ROI (e.g., only PFC region).
To do so, I do make a correlation matrix between voxels in the restricted ROI and voxels in whole gray matter mask (or default whole brain mask) before applying threshodling (r>0.025) and counting or averaging.

大家好，

最近用Rest做了基于系数的mGCA,结果出来了，是个12*12的P值(12个ROI)，但是我不知道这个系数应该如何看，是row to column 还是column to row？有文章说是前者，但是具体为什么我也不懂。

请各位前辈指教。。

谢谢。
3.15E-24 0.777128 0.183973 0.372583 0.426758 0.267168 0.911077 0.090198 0.95062 0.975273 0.867513 0.836962
0.866069 3.43E-24 0.685414 0.652474 0.04724 0.091468 0.635144 0.644233 0.269022 0.955114 0.757072 0.555135

Dear Authors,
I would like to obtain, for each subject, a matrix of the correlation between the seed and all the voxels of the brain.
Is it possible to obtain such a ".mat" file from a functional connectivity analysis?