October 2012

Names of ROIs

 Dear all -
I extracted the connectivity matrix between all ROIs from the atlases provided with DPARSFA (AAL, Craddock, Dosenbach, ...). How do I find out the name of each ROI for each atlas? For the Harvard Oxford Atlas a file with anatomical labels is provided, but I'm not sure on how to use that.

vierwer错误

我用zReHo,zfALFF做完单样本t检验,用Rest的Viewer看时,没办法调节p值,出现错误
??? Undefined function or method 'tcdf' for input arguments of
type 'double'.

Error in ==> rest_sliceviewer>ThrdtoP at 4910
    AConfig.Overlay.ValueP=2*(1-tcdf(Thrd,AConfig.Df.Ttest));
Error in ==> rest_sliceviewer>SetThrdAbsValue at 2988

关于ReHo,ALFF的统计检验问题

大家好:
在用dparsf软件得到ReHo,ALFF后,我用rest做了双样本t检验(对照组的smReHo,抑郁组的smReHo。对照组smALFF,抑郁组的smALFF)我有几个问题想问问大家。
               1   这样做出来的结果具有统计学上的显著差异么?   如果没有请问为什么呢?   

REST软件包计算的cluster中voxel数目需要剔除白质么?

大家好:
我用REST-Utilities-XJVIEW-CI. Report计算cluster中VOXEL数目,发现Total的cluster数目是39,但是其中有WHITE MATTER 11个,这种情况下,在文章报道中,需要写39还是28?

谢谢

请教严老师及大家,如何提取杏仁核作ROI?谢谢

大家好,严老师好,我想比较两组被试的杏仁核体积、活动强度及功能连接强度的差异,除了手画、任务态激活区检测之外,现在比较常用的方法是怎样的,要用什么软件?期待回复

ReHo表格中 Voxel (Size)的问题

 大家好 我的问题还是关于Voxel size的。我看到有人得表格里面报道Voxel Size,也有Voxels Number, 
   1. 后者很好理解,但是前者是不是(Voxel Number*重切后单个体素的体积大小)得到的数值?

   2.怎么能得到准确的Voxel Number呢?
      我以前的师兄是用自己编写的程序提取一定T值之上的体素的坐标,转换成TALARAICH,然后利用一个软件计算出来,最后剔除白质/CSF/非脑区后剩下的,但是我觉得这个方法不准确(感觉而已)。
      大家有什么好的推荐吗?