December 2013

关于灰质mask

老师们好:
在老师们实验室的文章(Wang ZQ,et al ,2011, HBM)做mALFF时提到“The global mean ALFF value was calculated for each participant within a group GM mask obtained by selecting a threshold of 0.2 on the mean GM map of all 54 subjects.”  这里是不是意味着在DPASFA中,做ALFF+fALFF前选的mask应该为自己定义的灰质mask?

DICOM to NIFTI using DPARSF

 Hello,

I have no much experience in f-mri analysis. I have a set of 197 files in DICOM format that I want to analyze using SPM8

First I want to make some preprocessing including  convert DICOM files to NIFTI files using DPARSF. But I have some problems using DPAERF

I used tha parameteres:

关于REST的时间序列提取功能

         REST 提供了很好很强大的ROI时间序列提取(Extract ROI Signal )功能,可以非常方便的提取ROI的数值,我以前的研究从中受益很多。

    最近的研究,要求不仅仅提取出一个ROI的平均时间序列,还要提取这个ROI中每一个Voxel的时间序列,不知需要如何将该程序修改或重写?多谢指教!

  

GCA的基于残差的方法

请教老师GCA基于residual的方法,不能算多个roi么。基于coefficient可以算多个roi,但结果有正负。我因为关于roi之间的连接要做双样本t检验,它不像基于voxel的可以在spm中做,分别建立正负mask。但roi之间的连接是数值,只能在spss里做,那正负相减不能说明实际上增高还是减低(由-1减去-2,是正值,可是-2是不是表示抑制作用加强了呢)。
而且遇到纵向的数据,观察效应连接随时间点的变化,可能一会正一会负,用回归模型还科学么
表达的比较细碎,谢谢老师!

Two sample t-test of FC

老师们好,
我已经运用ICA方法提取出病人组及正常组的DMN网络,现在我想比较之间的差别。取了10个aal脑区的ROI,用DPARSF做ROI-wised analysis, 计算出了10个ROI之间两两相关的FC,下一步想比较两组间10个ROI的FC强度之间差别。我想请问接下来如果要进行two sample t-test的话,应该如何进行?