请教如何计算各脑区的体积和密度信息

论坛版主:
你们好!
不好意思,打扰你们了,我想请教各位一个如何提取各个脑区的体积信息。结构的数据我已经有了,用VBM处理过数据,但我感兴趣的是每个脑区体积的信息,而不是总体灰质或白质的情况,比如我想提取AAL模板中第58个脑区的体积数据

,不知道有没能软件能实现这个功能。
谢谢!!

band pass for fALFF?

Hi, I recently download the REST toolbox. I wonder why the ideal Band Pass option is disabled in fALFF gui? I would think one'd want to band pass for this analysis, like in ALFF analysis?

Also, just want to check. For input files entered in ALFF, fALFF, and RoHe gui, I should use preprocessed data (after realign, slice timing, normalize and smooth?)

Thanks very much.

烦人的白质激活区

各位老师:
你们好!我想请教一个困扰很久的问题,我在处理数据统计ReHo结果时(其实计算其他方面如任务态的激活区也一样),单样本t检验的结果还好,绝大多数统计增高区峰值点在灰质区,可是一做双样本t检验或者配对t检验,统计增高区就会遍布在白质,脑室脑池内等等,而峰值坐标位于灰质区的很少。我想请教老师,这是什么原因啊?以前听老师讲在做双样本或者配对t检验时,要加入协变量,这个怎么实现啊?谢谢老师!

如何确认BoundingBox Size的大小是否合适?

1.DPARSF_V2.0_110505中BoundingBox Size为 【-90 -26 -72;90 90 108】,SPM中默认为【-78 -112 -50; 78 76 85】,论坛中严老师提到后者的大小过小。
请问,我如何确认什么样的BoundingBox Size比较适合我的数据?

2.BoundingBox Size是以什么为坐标原点的?

3.改变DPARSF_V2.0_110505中BoundingBox的默认值后,后续分析过程出错(回归头动等协变量),如何解决?

extract ROI Time Course

我在用rest中的utilities中的Extract ROI Time Course做时间序列提取的时候经常出现
“???error using==>copyfile;
另一个程序正在使用此文件,进程无法访问。”
这样的错误。我重启电脑重启matlab再运行,还是出现报出这个错误。
请问是否有谁在使用的时候出现过类似问题,该怎么解决呢?
谢谢1

用什么能看白质差异的结果图?报出差异脑区?

管理员辛苦了,不好意思打搅您了。

我用vbm分割后算白质,然后用xjview看,他并不能很好的告诉我在白质的哪个区域,并且报出这个区域有多少voxel,这个应该怎么办呢?

比如我们的AAL他是依据灰质分割的,区域中没有白质的区域。有没有白质的模板呢?

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关于rest读数据函数的问题

您好,我看了下rest工具包,读数据有这三个函数。

rest_ReadAnalyzeImage;rest_readfile;rest_ReadNiftiImage;

我试了一下用rest_ReadAnalyzeImage读nifti数据,也能读进matlab里,和用rest_ReadNiftiImage数据的结果是一致的。那么我是不是可以混用呢?

视频中说mricro看不了nifti的结果,可是我用spm8处理之后的img,是可以用mricro看的,这句话如何理解呢?

谢谢

统计静息态功能磁共振结果和临床症状的相关性

我已经使用DPARSF计算了病人和健康对照的ALFF、fALFF和ReHo,并在spm内比较,得出有显著差异的脑区。我想进一步统计,计算这些有差异的脑区的ALFF等和临床症状的相关性(临床症状是连续性数值)。还有我的问题是如果是三组比较,比如病人一组,有症状但不符合诊断标准的人群为一组,正常人为一组,这个比较在spm里怎么做,还有mask怎么做呢?