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something wrong with cohe_reho

 i got 150 volumes during one session and i am intrested in the 111~150 volumes. It is ok with alff, falff, and kcc_reho, but something is wrong with cohe_reho. The error message is reported as following. but if all the 150 volumes were used, it is ok to calculate cohe_reho. Is that coho_reho needs a minimum amount of volumes to function? if that, what is the minimum amount?

ROI-Wise分析请教

老师,您好!
我计算了8个人的两个ROI之间的相关值,也就是有8个FC值,也有8个zFC值,还有每个ROI的时间序列,那么该怎么计算呢?使用哪个文件,直接求平均吗?怎么知道相关有没有显著?
希望老师给予指导。

 

求助,关于cluster报告的一点疑问

大家好,请问
1.我在报结果的时候有几个脑区有重叠要怎么报?比如IFG,前面已经有一个脑区延伸至IFG了,后面还有个单独的IFG,是报一个就行了还是两个都要?。。。。
2.运行出来的结果在某个脑区正值负值都有。。。是不是有错误?
3.脑区的缩写有没有要求?还是自己解释了就可以了?
谢谢。这个3跟5都是同一个脑区,一正一负,怎么报?cluster10跟11都包含右中扣带回,怎么报?要报两次嘛?谢谢老师的回答。还有,大部分在白质去的团块的提速大小怎么报?某个团块比较大,峰值在中央旁小叶,但是里面包含了辅助运动区,而且比较大,另外一个cluster又单独找到了辅助运动区,那么这个辅助运动区是怎么报?问题有点多,谢谢老师的耐心解答。

关于atlas体素大小的问题

请问各位老师,如何将标准atlas voxel为2mmx2mmx2mm的模板转为3mmx3mmx3mm的呢?rest包里虽然有brodmann和aal61x73x61的,但是我想使用更多的模板。FSL中有很多自带的atlas模板,但voxel size都是2x2x2的,而我的数据是3x3x3的,怎么才能将这些模板转为体素大小3x3x3可用的呢?谢谢各位老师啦!

For statistics

臧老师及各位老师:
      您好!
      我有一组病人和一组正常人,都做了A、B、C、D、E问卷,这些问卷之间可能互相存在关联。在做低频振幅的时候,我将病人根据性别分为男、女组,根据治疗与否,分为治疗组及未治疗组,正常人根据年龄、性别选择1:1匹配。所有病人-正常人得到结果P1,P2,P3;女性病人-女性正常人得到结果F1,F2;男性病人-男性正常人得到M1,M2;治疗组-正常人得到结果Treat1,Treat2;未治疗组-正常人得到结果UntTreat1。
        根据这种情况, 统计分析应如何进行?以下哪种更合适?

关于REST软件中AlphaSim矫正设置问题

 老师好:
      REST中的统计做的双侧检验,而SPM做的单侧检验,在使用REST和Xjview看结果图的时候,它们的p值之间有个倍数关系,REST的p值要设成Xjview的一半。
     我想问下如果要在两个软件中实现相同阈值的AlphaSim矫正的话,这两个软件此时的P值还是不一样?REST软件中计算那个AlphaSim矫正表还能用在Xjview中吗,需要做修改吗?

请教高手帮忙看看这个统计分析。

T2-34 P=0.01 T=2.8188

This report is based on CUI Xu's xjview. (http://www.alivelearn.net/xjview/)

统计分析时cluster是否需要相加啊?

 各位老师好,我现在统计分析遇到几个问题,如下

Cluster 10

Number of voxels: 30

Peak MNI coordinate: 0 -15  60

关于overlay的问题

 各位老师好,之前没怎么注意这个overlay到底选什么,现在看了一下视频,overlay选的是××××.img。。。。但是我统计的时候一直用的是××××.nii,请问这有什么不同吗?好像我统计生成的结果就是只有.nii文件,没看到.img文件啊。。。不知道这样可不可行,谢谢各位老师的回答。

多元GCA

 老师,
您好,做GCA分析时,选择的数据是不是做完平滑和滤波之后的.nii文件,在FunImgARCWSF文件夹中?
我计算了几个ROI的多元GCA,结果出现两个文件order1和order2,请问这两个文件应该怎么使用,需要用哪个?
谢谢老师指点~

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