欢迎到静息态功能磁共振成像论坛
Welcome to the forum of resting-state fMRI

脑区翻转问题

 老师好! 我现在手上有批病人数据,总的数据量还是挺多的,但是这些病人的病灶区不是都在同一侧,分成左右病灶组的话被试的数量就不多了,我现在研究的一个功能区并没有偏侧性,所以我想把这些病人的病灶人为地翻转,使它们在同一侧,之前好像看过一篇文献里提过这种技术但是没细讲实现过程,请问各位老师有什么软件可以做这个或者有什么经典文献?万分感谢啊!!

请教功能连接可以只有正的结果么

请教老师采用怎样的预处理或方法能够使静息态的功能连接的结果只有正值没有负值呢,我试了不去除全脑平均协变量,还是有负值。如果两个脑区的连接值是负值,那负值的绝对值越大,能说明功能连接越小么,谢谢老师!
还有gca的基于系数的结果有正有负,负的是说明抑制么,从-1变成-2是说明抑制作用增加么,谢谢老师!

关于AlphaSim校正所用的FWHM到底该用预处理时的平滑核还是用SPM生成的统计图(con .img/spmT .img)估计出的平滑核?

各位老师,在下的问题如题目中所言:
关于AlphaSim校正所用的FWHM到底该用预处理时的平滑核还是用SPM生成的统计图(con .img/spmT .img)估计出的平滑核?
在下处理任务态fMRI的结果时,如果用预处理的平滑核FWHM=8,则结果有较多激活。
但若用REST的AlphaSim软件估计出的平滑核,则要大很多(且此值和SPM生成的全脑报表中的FWHM大小一致,17.5,17.2,17.2),如果按此值来做校正,则无显著激活存留。
在下翻遍了之前此论坛的帖子,未发现有明确说明此问题或给出明确答案的帖子。到底该用哪个平滑核呢?????
在下疑惑万分,心急如焚,还请各位老师不吝赐教!

请问DPARSF如何处理任务态数据?

事件相关设计,是不是模仿静息态,将事件前时间点文件放在一个文件夹,事件后时间点文件放在另一个文件夹,相当于转化为观察组和对照组数据?
这样统计分析也可以用rest完成?

是否为循环分析

 我用reho做出两组的差异区,然后用差异区作为种子点进行全脑功能连接,算是循环分析吗?谢谢!

去除协变量

老师们好,
对于rest中两个去除协变量的函数Brain4D_RegressOutCovariables和Brain1D_RegressOutCovariables都是使用( E - X(X'X)~X')Y过程,我想问一下这两个函数有什么区别,都是去除哪些协变量的,去除方法是线性回归?

关于灰质mask

老师们好:
在老师们实验室的文章(Wang ZQ,et al ,2011, HBM)做mALFF时提到“The global mean ALFF value was calculated for each participant within a group GM mask obtained by selecting a threshold of 0.2 on the mean GM map of all 54 subjects.”  这里是不是意味着在DPASFA中,做ALFF+fALFF前选的mask应该为自己定义的灰质mask?

取roi小球制作mask

请教老师:通过rest的提取roi可以在‘view roi’那步保存图像,形成一个roi小球的mask图像,那么通过现有的软件可以实现多个roi共同覆盖的mask么,还是需要通过编程实现,谢谢老师!

推导TR的小经验

最近处理一批数据时,发现部分被试头文件中的TR值与扫描时设置的不同,原因未知,而且有几个被试的TR信息丢失,时间点已知,通过计算总时间推算

DICOM to NIFTI using DPARSF

 Hello,

I have no much experience in f-mri analysis. I have a set of 197 files in DICOM format that I want to analyze using SPM8

First I want to make some preprocessing including  convert DICOM files to NIFTI files using DPARSF. But I have some problems using DPAERF

I used tha parameteres:

Syndicate content