Forum of resting-state fMRI

Hi,

各位，
我初学SPM，遇到了两个问题，还望指教
1、DICOM图像经过SPM分割后生成.img格式文件，但我将该数据利用matlab进行了一项处理(SPM没有的)。所以，这时我的数据是.mat格式的了。
通过在网上查到的save_nii.m文件，的确可以将.mat格式的文件转换成analyze格式。但是数据量却剧增。分割后的数据大约30M，而转换后的数据却达到了150M。
即便是我将.img格式文件读入到matlab，不经过任何处理，通过save_nii.m保存，数据也达到了150M。
不知谁遇到过这种问题，如何解决？

2、目前，我有一套数据，176*448*512
SPM一运行estimate就会出现out of memory的问题

Hi,

I just started using REST toolkit. Since all my data are in .nii format, I need to convert them to ANALZE 7.5 before using the toolkit.

老师：
您好，我是一名初学者，对于刚刚运用rest软件有一些问题，还望赐教：
我运用rest的rest dicom sorter，将后缀名设为dcm,后续操作根据视频中所记载操作，结果在matlab中出现如下报错：
??? Reference to non-existent field 'ProtocolName'.

Error in ==> rest_DicomSorter at 33
dirname=[outdir,filesep,dicominfotmp.PatientID,filesep,Indextmp(end-3:end),'_',dicominfotmp.ProtocolName];

Error in ==> rest_DicomSorter_gui>btnRun_Callback at 166

严老师：
你好！
在做双样本T检验时，1-1在课件里好像讲的意思是在spm表示单侧T检验，要是我又想看试验组高于对照组又低于对照组的双侧检验时，怎么处理呢？

老师，你好！遇到一些问题，请帮忙！
我做的是治疗前后REHO的变化。对治疗前与治疗后的REHO用REST做了配对T检验，得到有差异的脑区共12个。我想做一下这些差异脑区与临床症状的关系：rest-slice viewer-save cluster。保存了12个ROI的MASK。然后用每个病人的REHO图分别与这12个MASK进行相乘(rest Image calculator做)，共相乘了12次，每个ROI一次。每个ROI得到一组output.image.再把每个ROI的output.image与临床症状评分做相关（text文件），用rest correlation analysis做的，结果报错！报错如下：

Image Files in the Group:
output00001.img
output00002.img
output00003.img

老师，你好！我用SPM5和REST分别做出来的Paired-T检验结果不一致，重复了好几次都是不一样。可能是什么原因？是我的方法的原因？都是按照教程做的呀

Warning: In the directory "D:\spmrestetc\spm5\spm5", spm_bsplins.mexw32 now shadows spm_bsplins.dll.
Please see the MATLAB 7.1 Release Notes.
> In DPARSF_run at 629
In DPARSF>pushbuttonRun_Callback at 939
In gui_mainfcn at 96
In DPARSF at 41
??? Error using ==> class
Cannot change the number of fields of class 'file_array' without first typing 'clear classes'.

各位老师：
你们好，很感谢上次给我的回复，很有用，谢谢！
我在做One sample T test时最后result 定义好contrast 后在threshold{T or p value}填好0.005或者0.001后就不再出现让填多少体素的选项了，倒是也生成了spmT_0001.img文件，matlab里出现如下：
spm{T} image 1 : ...written spmT_000.img
SPM computation : ...height threshold>>
然后就spm就不动了，好像死机了一样，matlab要关掉重新启动才行，不知道这是怎么回事，是不是哪里出错了，要怎么解决呢？

您好，我最近正在学习GCA，使用你们的GCA工具中碰到了一些问题，想向你们请教，万分感谢!