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VBM DPARSF

严老师,您好,请问:

在做VBM的modulation时候我们经常这样选择:
单击Modulated normalized选择“affine+non-linear only”。这里的affine+non-linear only是什么意义,是说T1像经过affine和non-linear两次normalization,然后得到一幅MNI的图像?
在DPARSFA的VBM里面是如何选择normalization和modulation过程的。

谢谢!

计算差异的差异

老师好:
      我有一个统计的问题。我有两大组,每组内有两组数据,我分别用two sample t-test计算了这两组数据的差异。现在我想计算这两组数据的差异之间的差异,应该用什么方法呢? 还是我一开始统计就应该用其他方法? 请老师指教!谢谢!

请教:如何得到MNI space 中的T1 MRI

 各位老师,同学好,
请教一下,用DPARSFA处理fMRI时我使用了T1项做coregistration,然后做normalization,但我没找到normalize 到 MNI space之后的T1 MRI. 
是不是说,用做完coregistration 之后的 T1 计算如何normalize fmri 到 MNI space后仅仅把参数用在fMRI上,并没有保存 MNI space中的的T1 ? 有没什么方法可以得到它呢?
另外在PicturesForChkNormalization 中有些subject 有些灰质和颅骨都重合了,如下图横断面,这样的subject是不是就不可以用了?或者是不是哪里的参数设置不合适,如何改进它呢?
非常感谢!

请教一个问题,关于DPARSFA处理后的统计数据的选择。

请教各位老师一个问题:
    我用DPARSFA处理数据,选择里面的“Calculate in MNI Space(warp by DARTEL)”处理流程,先跑完ALFF,再做Filter。这样的话最后的统计分析应该是选生成的“Results”文件夹里的数据,还是要选择“FunImgARCWSF”里的数据?
    还有就是,我看了一下数据处理时Matlab里面的代码,Filter时是对FunImgARCWS文件夹里面的数据进行滤波,而不是对Results\ALFF里面的数据进行滤波。这样的话,即是说Results\ALFF里面的数据是没有滤波过的?

附上代码:

关于功能连接单样本t检验的问题

各位老师和同学,

请教以下问题:

预处理:数据去除了全脑均值,白质,脑脊液,头动,在DPARSF进行。

功能连接:种子点在左侧初级听觉皮层,做voxel-wise的功能连接分析,得到每个受试者的z-FC图。然后对29名受试者的z-FC图进行单样本t检验。结果发现很多区域的t值十分大(三位数),导致即使p值调到很低(例如0.000001),存活的cluster依然很多。

我的问题是,这么大的t值是否正常?

报错,头动校正后找不到Masks

老师,您好!

我想算ReHo,但头动校正后程序有如下报错:

 Extracting ROI signals...
  Read 3D EPI functional images: "E:\1 M1 Preparation\Data processing\human data\Reho\FunImgAR\D99".......................................
Error using y_ExtractROISignal (line 188)
Wrong ROI definition, please check:

degree centrality out of memory 命令行和虚拟内存更改均没有效果

 大家好:

我刚接触DPARSFA,所用的电脑内存只有两个G,
每次运行到degree centrality就会报错,提示out of memory。
用命令行:BCDedit/ set PAE forceenable windows
               BCDedit/set increaseuserva 3072
提示操作成功。电脑重启运行还是这儿报错。
将电脑虚拟非系统盘4G内存,还是出现同样的错误。

我看论坛上出现memory错误的都是按照FAQ 问题2所示的改,然后就没看到后续情况,不知道能否运行。

How to use other covariates checkbox in Nuisance Covariates Regression for multiple subjects

I always appreciate your help.
I'm performing resting-state functional connectivity analysis with data from multiple subjects.

关于功能连接的疑问

老师们,你们好!
  请教一个问题,有患者与对照两组人群,利用ALFF做研究指标,发现(1)单样本T检验时两组区域的A区域与B区域的ALFF都增高,(2)对于A区域患者的ALFF小于对照;对于B区域患者ALFF大于B。接着我们做了以B区域为ROI的voxel-wise的功能连接,发现相对于正常对照,患者A与B区域之间的负相功能连接增强,B与另一区域C的正向功能连接增强,这时我们能否这样解释:B区域静息活动增强时,A区域的静息活动受到抑制,或者说B区域静息活动增强时A区域出现静息活动减弱的可能性更高;B区域活动增强时,C区域静息活动也增强?
  我们这样解释有问题吗?

Different t-values found for comparison done in Rest vs SPM

Hello,

I recently generated some correlation maps.  I then performed the Fisher Z transform on those maps.  I fed those z-maps into the Rest Statistical Analysis tool to perform t-tests to look for differences between the groups.

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