欢迎到静息态功能磁共振成像论坛
Welcome to the forum of resting-state fMRI

各位老师,菜鸟请教一个功能连接图的问题

       本人想做一个关于耳鸣治疗前后的FC改变的图。根据文献(Maudoux, A., P. Lefebvre, et al. (2012). "Auditory resting-state network connectivity in tinnitus: a functional MRI study." PLoS One 7(5): e36222.)的23个ROI进行FC计算,得到相应的*ResultCorr.txt结果,使用brainnet工具可以生成单个对象的功能连接线图。请问如何得到治疗前后组的*ResultCorr以及经过配对T检验的*ResultCorr??以下是单个对象的线图

有关xjview

尊敬的各位老师:
       我把网上下的xjview的软件包解压到matlab的toolbox的文件夹下,可以在rest的软件打开report,但是在matlab的command的窗口中却不能打开,跳出如下图,请老师看看具体原因是什么啊?

补充一个校正问题

严老师:
   用rest1.8 sliceviewer中的一个校正问题。
我用alphasim校正(cluster size大于228,rmm=5),正负两个cluster有边相连,正cluster2021个voxels,而负的只有28个voxels也被保留下来了,而且归到正的cluster里了。请问这种情况是正常的吗,还是需要去掉那28个负的体素?

     祝好

使用rest1.8时候出现的一些问题

严老师:
   您好,我在使用rest1.8 sliceviewer时经常出现一些问题,想向您咨询一下。
1. 在服务器上用小键盘设定p值时经常出现乱码,而用大键盘时正常。
2. 校正后和校正前自动生成的Color bar是完全一样的,个人认为校正后的color bar 的top值和bottom值应该随着校正而改变。
3. color bar中两个色块中的整数代表的是上一个色块还是下一个色块,特别是map中的color值都是整数的时候,比如overlap,我发现有时候代表上一个色块,有时候代表下一个下一个色块。
     祝好

关于时间点time point 的填写问题

各位老师你们好,我是一名数据处理的新手,在预处理数据进行到detrend 这一步时想用dparsf软件处理,(因为时间点的问题前面都是只能用spm处理,在这一步spm总是报错);当我把输入数据到dparsf,出现以下提示:
如果使用spm,则报错以下内容:

求VBM教程(DPARSFA)

严老师好,学习了您的DPARSF视频后,受益菲浅。现需要进行VBM处理,觉得DPARSFA中VBM好用,但具体步骤不会操作,参数不会选择。希望得到您的指点。谢谢。

z标准化的方法

各位老师好:

从文献中看到,做完ICA之后,如果想做T-test,就得把ICA得到的成分做个z标准化,我想请问一下,这个z标准化可以用什么软件实现?

GIFT的utilities里面有一项是Z-shift,用它可以实现吗?我看manual上是这么说的:

“Z-shift is used to center the image distribution to zero based on the peak of the distribution.”

这句话是什么意思?

还望各位老师能为我解惑,谢谢!

DPARSF报错

 严老师:
您好,我使用DPARSF进行数据预处理出现下面错误
我是win7 64位系统,matlab2010b 64位,rest1.8,DPARSF2.2

rest-gca

各位老师:
 我是刚接触rest-gca,对一些基本问题不太了解,希望得到老师们的指导:
 问题一:我对voxel wise和roi wise的理解和定义不太清楚,两者的具体含义是什么,
 问题二:必须有mask吗,gca就用时间序列分析不就行吗
 问题三:我运行时 Exception occured     subscripted assignment  dimension mismatch的问题怎么回事

Alphasim question

Dear All,

After my paired t-test analysis, I would like to use Alphasim for multiple comparision correction....however, I'm not sure about the procedure...
From what I saw in the video, it seems to be 1) set the p value in slice viewer 2)check the list of alphasim correction provided in slice viewer and 3)enter in the cluster size value, etc accordingly....

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