Forum of resting-state fMRI

各位老师：
你们好！我想请教一个困扰很久的问题，我在处理数据统计ReHo结果时（其实计算其他方面如任务态的激活区也一样），单样本t检验的结果还好，绝大多数统计增高区峰值点在灰质区，可是一做双样本t检验或者配对t检验，统计增高区就会遍布在白质，脑室脑池内等等，而峰值坐标位于灰质区的很少。我想请教老师，这是什么原因啊？以前听老师讲在做双样本或者配对t检验时，要加入协变量，这个怎么实现啊？谢谢老师！

1.DPARSF_V2.0_110505中BoundingBox Size为 【-90 -26 -72；90 90 108】，SPM中默认为【-78 -112 -50; 78 76 85】,论坛中严老师提到后者的大小过小。
请问，我如何确认什么样的BoundingBox Size比较适合我的数据？

2.BoundingBox Size是以什么为坐标原点的？

3.改变DPARSF_V2.0_110505中BoundingBox的默认值后，后续分析过程出错（回归头动等协变量），如何解决？

管理员：
我想做一个附件中的大脑示意图，图中的红点需要根据我的实验结果点上去，请问怎么做，谢谢。

我在用rest中的utilities中的Extract ROI Time Course做时间序列提取的时候经常出现
“？？？error using==>copyfile;
另一个程序正在使用此文件，进程无法访问。”
这样的错误。我重启电脑重启matlab再运行，还是出现报出这个错误。
请问是否有谁在使用的时候出现过类似问题，该怎么解决呢？
谢谢1

管理员辛苦了，不好意思打搅您了。

我用vbm分割后算白质，然后用xjview看，他并不能很好的告诉我在白质的哪个区域，并且报出这个区域有多少voxel，这个应该怎么办呢？

比如我们的AAL他是依据灰质分割的，区域中没有白质的区域。有没有白质的模板呢？

Hi
I am trying to do the functional connectivity analysis on a single slice (2D) of rat brain acquired with EPI, for 5 minutes, around 3000 time points.

您好，我看了下rest工具包，读数据有这三个函数。

rest_ReadAnalyzeImage；rest_readfile；rest_ReadNiftiImage；

我试了一下用rest_ReadAnalyzeImage读nifti数据，也能读进matlab里，和用rest_ReadNiftiImage数据的结果是一致的。那么我是不是可以混用呢？

视频中说mricro看不了nifti的结果，可是我用spm8处理之后的img，是可以用mricro看的，这句话如何理解呢？

谢谢

我已经使用DPARSF计算了病人和健康对照的ALFF、fALFF和ReHo，并在spm内比较，得出有显著差异的脑区。我想进一步统计，计算这些有差异的脑区的ALFF等和临床症状的相关性（临床症状是连续性数值）。还有我的问题是如果是三组比较，比如病人一组，有症状但不符合诊断标准的人群为一组，正常人为一组，这个比较在spm里怎么做，还有mask怎么做呢？

rest算出来的相关系数，数学算法是什么，没有找到软件算法的相关文章。
例如，用functional connectivity，算ROI wise，两个ROI之间有个相关系数。
或者算voxel wise时，全脑每个voxel和特定ROI之间的相关系数。
应该不是线性相关，我将time course 用SPSS或者excel算出来的相关系数，和rest的不一样。
是不是考虑了频率成分？

When I load an ".img" to display in the "Slice Viewer" of the"rest",
the size change like as follows:

the image size is 79*95*68.
How to over come is problem? Thank you!