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有关ica做t检验

尊敬的老师:
      我刚开始学习影像处理,最近做在用gift做ica,很多文献说做各个component的one—sample t检验,因为gift做出来后是以sub为单位做成压缩文件的,所以我就将每个sub文件解压,挑出相应的component,但是用spm做t检验时没有发现voxel,想问原因,还是说我这么做的方法本来就是错误的。

关于写论文的一些问题

 大家好:如下图所示,这是我从一篇论文中截下来的图。我想知道这个BA分区是怎么得到的,脑区是怎么和BA分区有关系的,用MRIcro软件可以得到么?

下图 我选取的是正常人和抑郁人有差异的体素坐标,转换到MNI上。然后在MRIcro上定位出这样子的结果。后面的步骤就不会了。如果可以接下来的步骤希望大家给我讲解下。谢谢大家!

有关ica的后续处理

    老师:我想用gift去算静息态的网络,先使用spm做预处理,然后用pca2次降维,再使用informax做back restruction,得出46个components后,有下面一些问题想请教您:
1、很多文献说按照模版比如DMN、背侧注意网络之类的挑选成分,我想问具体的流程是怎样的,因为只给出了这些网络包含了哪些脑区,却都没有说清楚具体是怎样操作的
2、有的文献还说要使用wfu等软件包设计ROI,但有的又说不用,这使我很迷茫

DPARSF 出错

DPARSF 2.2
REST 1.8
Matlab 2011b
WINDOWS 2008

出错信息

Index exceeds matrix dimensions.

Error in y_Normalize_WriteToMNI_DARTEL (line 47)
SPMJOB.matlabbatch{1,1}.spm.tools.dartel.mni_norm.data.subj(1,1).flowfield={[T1ImgNewSegmentDir,filesep,SubjectID,filesep,DirImg(1).name]};

请教一个关于重采样的问题

 请问当我们想用Rest软件进行重采样的时候,这个软件默认的精度是多少啊?(1*1*1还是3*3*3啊?)在进行重采样的时候,有没有一个原则是只能从精度高的往低的重采样,不能把低的往高地采啊?我们现在想将VBM结果进行Alphasim矫正,当用slice viewer打开我们的结果时会出来一个警告提示我们进行重采样,而我们的结构数据在扫描时是1*1*1,当进行预处理进行配准时变成了1.5*1.5*1.5,所以最后的结果应该是1.5*1.5*1.5的,这样的话我们重采样需要采成多少呢?谢谢老师~~~

Question on setting parameters

In the following lines, what does SliceOrder refer to? is it the order of slices from the first slice to the total number of slices? And what is the role of ReferenceSlice?

AutoDataProcessParameter.SliceTiming.SliceOrder=[1:2:239,2:2:240]; % REVISIT.... was [1:2:25,1:2:24]
AutoDataProcessParameter.SliceTiming.ReferenceSlice=25;

With thanks,

farras

AGE problems

各位老师好,
          学生是静息态的初学者,数据分析时遇到了一个问题,其实看起来是比较老的年龄问题,但是年龄确实是影响认知的因素,看了文章里一般都是年龄没有差异,或者是处理的时候回归掉让结果更加完美,但是如果不回归掉,在写文章的时候能否先回归得出结果然后再不回归的结果前后对比,如果差异不大则可以考虑暂时不计年龄的影响啊?是否需要这样说明一下?还是如果不进行调整的话做出来的结果可能不科学或者是不被认可?我试验中的年龄差异主要来源于其中两个组之间(一共三组被试),那我应该怎么做才能既不回避了年龄的因素,文章的统计方法上也没有错误呢?非常感谢!

灰质MASK问题

各位老师好:
                     请问我用REST里Template文件夹里自带的AAL_61*73*61作为灰质MASK行么?祝工作顺利谢谢!

咨询一个Slice viewer和Xjview相同P值下T值不一样的情况

老师您好:
请教一个在Slice viewer和Xjview中相同P值下T值不一样的情况:
我的数据是结构像数据,数据是1.5 X 1.5 X 1.5的,分析被试的灰质体积和问卷得分的相关,方法是在SPM中进行多元回归分析,得到的spmT_0001使用Xjview打开,设置p value=0.005,此时的T=2.8784,然后我使用Slice Viewer打开spmT_0001文件,设置p=0.005,此时的T=3.1966。两个软件输入相同的p值对应的T值不一致,不知道是什么原因。

DPARSF outputs/results for second level analyses

 Hi guys,

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