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ROI WISE

 老师您好:
  
      我用dparsf得到10个脑区之间的相关文件,经过T检验后,该如何做FDR校正?若是脑区和全脑的话,会有Zmap img生成,就是txt文件该如何做呢?希望老师能帮我解决疑惑。

谢谢


xjview里根据peak点选取roi

根据xjview里显示的cluster及peak点,选取最大峰值点作为小球roi的中心,下一步要做效应连接,但是一个T值很大的cluster的三个峰值点坐标都是白质的,比如xjview显示“ // Left Cerebrum // Frontal Lobe // Sub-Gyral // White Matter // undefined // Frontal_Inf_Tri_L (aal)"这是已经用了灰质mask了,而且cluster里白质还挺多,请问老师怎么选取roi中心好呢。可以选取这个落在白质区的最大peak点么,还是选择落在灰质区的Frontal_Inf_Tri_L,但不是最大的激活点作为roi中心呢?
1955 Left Cerebrum
 1795 Frontal Lobe

请教dparsfa或dparsf预处理之后的结果怎样做specify 1st-level个体统计

请教下spm中做个体统计1st-level,输入的是文件名以“swra"开头的预处理后的文件(spm预处理),是平滑之后未滤波,没去协变量的。但我想输入经过detrended,filter,covremoved之后的数据,输入后会报错。那请问想输入经过dparsfa预处理的数据进行个体统计,怎么办呢 谢谢老师!

Index exceeds matrix dimensions.

用dparsf处理数据时,报错,错误为:Index exceeds matrix dimensions.
请问为什么会出现这个问题?

请教

严老师,您好,我用新版DPARSF_A的Basic Version跑静息态数据,得到的Results文件夹里,有zFCMap_sub001_....nii格式数据。但在Rest软件"Add Group Images" 里输入结果时,提示“There is no data or non-data files in this directory, please re-select”。

去年我用DPARSF跑数据的时候,在Results文件夹里有.hdr/.img格式文件。请问现在如何输入Results的结果文件呢?
多谢!

SPM error report

 Dear Members,

I am analysing rFMRI of 2 subjects. I am doing ReHo analysis by using REST. I have done all the analysis as mentioned in the REST Course ppt. But I am facing some probelm in result part.

>When I statr to use SPM for one sample t-test I am getting some error report which I pasted below.

用dparsf 头动校正

老师您好:
      我用dparsf头动校正后,生成ExcludeSubjects.txt 文件,我想剔除几个头动较大的被试,我是不是直接删除头动较大的被试呢,然后继续后面的操作,还是需要其他处理?

谢谢老师!

文章大修,审稿人关于DPARSF预处理的问题,望请各位同道指教

最近自己的一篇文章被PLOS ONE大修,方法学比较简单:一组病人与正常人之间ALFF自发脑活动的比较,数据的处理全部都是使用DPARSF进行的标准处理流程。

但是审稿人提了很多数据处理技术上的问题,鉴于自己的医学背景,望请各位高人指教,谢谢。

咨询

 请教一下,我在用DPARSF处理数据的时候,始终在Slice timing上报错,请见图片呈现的报错内容(见图)。我在2012年处理的时候,用同样的数据和参数处理没有任何问题,现在用的是Matlab R2012b和SPM8,请问这个是否会对处理程序有影响?多谢!

如何根据GM异常的结果设定mask以提取与之存在结构连接的WM信息?

最近,我们发现疼痛敏感性的个体差异与楔前叶(precuneus)的灰质体积GMV异常有关(高敏感性个体GMV↘)。我们希望根据已采集的DTI,进一步检验与 precuneus 相连的白质纤维是否同样有结构异常。由于技术限制,我们目前打算只做FA与行为的相关分析,但是遇到一些问题,希望各位老师予以解答:

1. 这项研究的目的是探索目标行为敏感性的脑结构基础,如前所述,我们根据GMV结果选定precuneus为兴趣区,然后从白质FA的角度进一步 “验证” Precuneus结构差异的重要性(正在跑数据尚未拿到结果),就研究思路来说,这个做法可行吗?

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