关于cluster report报告生成,学习了张老师的v2.0,遇到一些具体问题

张老师,您好!非常感谢您的 “How to report my result using REST slice viewer? v2.0”  ,我在实际操作过程中遇到了一些问题,特向您请教。
1. 首先确认一个问题,我理解的alphasim校正是通过控制cluster的大小来实现的,这个理解对吗?

degree centrality 数据处理问题

 各位老师:
您好,数据预处理采用的是DPARSFA2.3,已经得到degree centrality 文件夹,里面有6种数据:无prefix的二值化数据和加权数据,prefix为s的二值化数据和加权数据,以及prefix为z的二值化数据和加权数据。
我有两个问题:
1.数据还没有做smooth,用DPARSFA2.3可以继续做吗?选择FunImg还是FunRaw?如果选择FunImg,采用哪个结果文件继续跑?
2.我试着用SPM8做了一下smooth,degree centrality 文件夹里的所有数据都加了一个prefix-s,请问下一步我要做统计分析的话采用那组数据?
期待您的热心回复。
zhang
jinling hospital

关于校正的问题

大家好。

想请教个关于校正的问题。

在做单样本T检验的时候是不是必须做矫正,如果alphsim不通过,可以换做FDR,或者再换别的;如果做两样本T检验的时候是不是就不用再矫正了,我看有些文献他们就是两样本就不在检验了,请问这是为什么?

如果如我所述,我该如何综合单样本和两样本的结果来报告显著的区域呢,因为在单样本中,病人和正常人在某个脑区可能都不显著,但是在两样本就显著,或者在单样本都显著而在两样本的时候却不显著了,我是不是应该主要以两样本为主,单样本的检验只是个辅助呢。

谢谢。

回归与方差分析协变量问题请教各位老师

各位老师好,
我有一个关于三组病人单因素三水平方差分析FA的问题,考虑到年龄可能对白质改变起影响,所以就想在做方差分析的时候设年龄为协变量。之前试验性地比较了有无协变量情况的主效应,发现F-map还是不一样的。

首先,我不是很确定这算不算协方差分析。
其次,如果按照协方差的分析,前提需要满足年龄这个协变量与三组病人图像的回归系数,也就是斜率是一致的,才可行协方差分析。
第三,如果要评价三组病人图像跟各自年龄的回归系数,该在SPM里怎么操作?另外,如果三者的回归系数不一致,也就是说三条回归方程线有交叉,那我应该怎么处理年龄这个因素呢?
最后,如果在anova当中加了年龄做协变量,那么在随后的组间比较(事后分析)的时候,我还需要在T检验的时候加每两组的年龄作为他们的协变量吗?

不知道表述的清不清楚,问题有点繁琐,先谢谢各位老师啦~

rest

老师您好,我刚刚开始学习应用这些软件。看了您的视频教程,在用REST处理原始数据的时候,选择REST—UTILITIES__REST DICOM SORTER,选择文件之后,不在空白那里出现,点击RUN,之后就出现这个
 
那个后缀名三种都试过,IMA,dcm,none都是这样结果。后来直接用光盘里面的数据也是这样。请问老师这是哪里出错了呢?多谢老师指教
另外,如果不用rest批处理的话,还可以用什么软件做批处理的呢?
再次感谢老师指教