Forum of resting-state fMRI

Warning: The fourth output, VERSN, of FILEPARTS will be removed in a future release.
> In fileparts at 35
In spm_slice_timing at 188
In spm_run_st at 25
In matlabbatch/private/cfg_run_cm at 29
In cfg_util>local_runcj at 1363
In cfg_util at 699
In spm_jobman at 207
In DPARSFA_run at 236
In DPARSFA>pushbuttonRun_Callback at 969
In gui_mainfcn at 96
In DPARSFA at 30

严老师，

你好！

我发现我normalize后的MRI图像的维数，和template的维数不一样，voxel size是一样的。这样正常吗？

非常感激！

Be cautious when regressing out covariates.
We simulated three random timecourses X, Y and Z that are normally distributed to perform linear regression. Let Y to be the ROI timecorese
and X, Z to be the covariates. The regression coefficients and residual after two-factor linear regression are extremely same with that of two Unary linear regressions. The results are as bellow:

严老师好：
我同您请教一个有关同一批受试者在不同时间点接受rfMRI检测的问题。应该如何分析会比较好一些。REST好像没有重复测定的方差分析，在分析VBM 时，有的文章使用前后两次时间点相减得到新的差异影响，然后比较差异影像在正常和患者的差别，不知Reho，FC和ALFF等指标可不可以使用这种分析。
谢谢，期待你的指教！

按照严老师视频安装使用caret，导入spec文件时会报错，我使用的caret5.6版本，在win7下操作，这是不是会导致这种错误？

各位老师好，请教两个关于ALFF的问题，谢谢：

1、我查看了REST里面的ALFF源程序，计算能量谱 = 2 * 频谱的平方 / N，请问这里为什么要除以N？

2、左西年老师的文章《The oscillating brain: Complex and reliable》中Fig1和公式（1）提到ALFF是Sum of amplitudes of PSD，而源程序里ALFF貌似是Mean of amplitudes of PSD，应该以哪个为准？

严老师，

你好！

我想要对fMRI time series 进行小波分析。 我用MODWT将原fMRI信号分解成几个components。 为了计算这些components的frequency range，我需要知道原fMRI的frequency range。 是0-1/TR吗？

非常感激！

A postdoc position is now open at The University of Pennsylvania, Perelman School of Medicine.

我不能在使用SPM8的情况下运行DPARSF，但是在SPM5下可以？有人遇到过这个问题吗？能帮忙解决吗？

严老师：您好
我发现用REST中用“SAVE CLUSTERS”功能保存的MASK，只有一对带灰度的img文件，不像用‘SAVE CLUSTER’功能会产生一对带灰度的MASK img文件，和一对二进制文件。我想问一下，用那个带灰度的img文件作为MASK进行统计合不合适。问这个问题的关键是我对SPM其内部识别MASK的条件标准不清楚，是只要voxel值大于0就认为是MASK，还是只有voxel值等于1才能认为其是MASK。请严老师多指教。