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Neonatal infant brain template

Does the REST used for the neonatal brain cogesteration purpose. If anyone is working for the same purpose,
could you please suggest which template (standard space) are you using for normalization of the data

拟合度分析方法来识别默认网络的成分

尊敬的老师:
      有文献使用用拟合度分析方法来研究某种疾病的默认网络与正常人的默认网络的差异。基本思路是:首先使用ROI-based方法得到默认模式网络模板;然后对预处理后的数据进行ICA 分析,使用拟合度分析方法挑选出与之前得到的默认模式网络模板最匹配的成分。拟合度分析主要通过模板匹配程序来完成,即计算每个成分中落在模板内体素的z 值的平均值与模板外体素的z 值的均值之差,选择差值最大的成分作为最匹配的成分。为了便于进行组分析,将每个被试的最适成分的时间序列作为回归量输入到SPM 的设计矩阵中,回归分析得到与最适成分相似的脑区激活图,  即默认模式网络。

ALFF/fALFF nuisance covariates regression

 请问在计算 ALFF/fALFF 时需要做 nuisance covariates regression (6 rigid-body parameters, CSF signals, white matter signal) 吗?

用DPARSF_V2.2_121225的一个报错

严老师,一个报错想请您分析一下:
用DPARSF_V2.2_121225,做到nuisance covariate regression时,出现以下错误,以前的版本却没有这个问题。

Extracting ROI signals...
  Read 3D EPI functional images: "G:\analysis\FunImgAR\sub_021a".........................................
??? Error using ==> y_ExtractROISignal at 188
Wrong ROI definition, please check:

VBM

老师:
      您好,请问用SPM8做VBM时,参数设置均为默认值,得到的结果里以m0wrp1开头的图像是不是经过标准化、调整后的灰质体积,这个图像有没有经过平滑呢?是不是需要再平滑一下才能做统计分析呢?谢谢!

Some issues about head motion analysis in new-edition DPARSF

严老师好!关于新版DPARSF的一点不解,望回复。
1. Polynomial trend:
     1). if input 2,为linear trend+quadratic trend,quadratic trend是什么意义?
     2). if input 3,为linear trend+quadratic trend+cubic trend,cubic trend是什么意义?

rest中t检验得到的t-map怎么转化成能显示坐标和t值的table呢?

各位老师好:
     我已经用rest处理得到了配对t检验的t-map文件,格式是”.nii”,然后用Slice View可以读取,也可以看cluster。但是我想看每个cluster里面除了peak点以外的t值比较大的点的坐标和t值,请问要怎么才可以得到这样的t值和坐标的table呢????

DPARSFA 出错

Matlab 2012a
Win2008 64bit
REST 1.8
DPARSFA 2.2

选项及操作内容见附件,我没有处理被试的T1图像,不知道在DPARSFA 中应该如何处理设置

Matlab 出错信息如下,多谢指教,谢谢!

Index exceeds matrix dimensions.

Error in y_Normalize_WriteToMNI_DARTEL (line 47)

各位老师,菜鸟请教一个功能连接图的问题

       本人想做一个关于耳鸣治疗前后的FC改变的图。根据文献(Maudoux, A., P. Lefebvre, et al. (2012). "Auditory resting-state network connectivity in tinnitus: a functional MRI study." PLoS One 7(5): e36222.)的23个ROI进行FC计算,得到相应的*ResultCorr.txt结果,使用brainnet工具可以生成单个对象的功能连接线图。请问如何得到治疗前后组的*ResultCorr以及经过配对T检验的*ResultCorr??以下是单个对象的线图

有关xjview

尊敬的各位老师:
       我把网上下的xjview的软件包解压到matlab的toolbox的文件夹下,可以在rest的软件打开report,但是在matlab的command的窗口中却不能打开,跳出如下图,请老师看看具体原因是什么啊?

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