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请教关于ALFF统计分析的问题

老师,您好,我现在刚接触数据处理,正在做ALFF分析,过程中遇到了一下几个问题,想请教一下:
1.单样本T检验中及双样本T检验中MASK怎么制作啊?我看到http://restfmri.net/forum/node/1040中说“ 制作MASK有个虽然笨但肯定不出错的方法告诉你,save clusters,然后在calculator里自己除以自己,即i1./i1,两幅单样本图都这样处理,相加之后再除以自己”:这个表达式具体怎么写啊?
2.我看到视频中单样本及双样本t检验是对mALFF及
mfALFF进行分析,主要是看这两个结果吗?
3.在Viewer中P值选择0.005、0.01、0.05,这个依据什么选择呢?

Error in preprocessing with DPARSF 2.1

老师您好,
      我用DPARSF 2.1进行数据预处理,刚开始做Slice Timing就出现错误,小白表示看不懂,求指教,非常感谢。
      PS:用的SPM5和REST_V1.8

错误如下:

Running "Slice Timing"

 
SPM5: spm_slice_timing (v$Rev: 112 $)              10:01:28 - 24/02/2014

aal 116ROI coordinates

 老师,

 您们好!
 
 我下载了AAL 116 roi center 的坐标。但使用一个软件看点分布的时候,发现只有一个大脑半球显示了AAL 的 ROIs。下载craddock坐标后,这个软件显示的是全脑node分布。很想问问使用AAL roi 中心坐标的时候是否需要注意些什么。。。?

 非常感谢!

between a restricted ROI x gray matter mask region for Degree Centrality

Hi REST experts,

I'd like to perform Degree Centrality analysis within restricted ROI (e.g., only PFC region).
To do so, I do make a correlation matrix between voxels in the restricted ROI and voxels in whole gray matter mask (or default whole brain mask) before applying threshodling (r>0.025) and counting or averaging.

mGCA 结果如何看

大家好,

最近用Rest做了基于系数的mGCA,结果出来了,是个12*12的P值(12个ROI),但是我不知道这个系数应该如何看,是row to column 还是column to row?有文章说是前者,但是具体为什么我也不懂。

请各位前辈指教。。

谢谢。
3.15E-24 0.777128 0.183973 0.372583 0.426758 0.267168 0.911077 0.090198 0.95062 0.975273 0.867513 0.836962
0.866069 3.43E-24 0.685414 0.652474 0.04724 0.091468 0.635144 0.644233 0.269022 0.955114 0.757072 0.555135

functional connectivity correlation matrix

Dear Authors,
I would like to obtain, for each subject, a matrix of the correlation between the seed and all the voxels of the brain.
Is it possible to obtain such a ".mat" file from a functional connectivity analysis?

利用rest制作BA脑区mask提取ROI信号出错

 利用rest viewer制作BA脑区mask提取ROI信号时,matlab提示:

??? Error using ==> rest_loadmask at 64

Mask does not match.

关于静息态磁共振重测信度

看了左老师一篇文章,提到静息态fMRI重测信度,

求助:请问有谁知道怎样提取差异脑区的ALFF值?

 我想将患者与正常对照相比差异改变脑区的ALLF值提取出来,便于在SPSS里与其他量表作相关分析,但是请问在REST里怎样将差异改变脑区的ALFF值提取出来呢?我不知道该怎样操作。 请高人指教下,谢谢!

dcm2nii error - Permission denied

 Hi,

I wanted to run dcm2nii on my raw dicom files. unfortunately, matlab says "converting Functional Images:Sub_026 OK/bin/bash: ./dcm2nii_mac: Permission denied" and doesn't transfer the dicoms into .nii format. I already used the terminal (mac) trying to solve the issue with "chmod u+x ./dcm2nii_mac". This didn't help.

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