欢迎到静息态功能磁共振成像论坛
Welcome to the forum of resting-state fMRI

File upload in DPARSF

 Dear Members,

I am trying to use DPARSF basic and advanced edition. I have downloaded demodata to learn connectivity analysis by using this software.  But I could not able to uplead images from demodata. I have attached screen sht with this mail. Please see the attached file and give me a solution.

Thank you
Ramesh

some questions about VMHC

Dear REST experts:

Recently I worked on the new function of VMHC on the REST software.

However, I had some questions which might need your kind help and explanations.

静息态数据做GCA的预处理

请问老师有的文献上做静息态的gca之前的预处理有所差别,尤其是在滤波,去除协变量部分,请问老师一般来说做gca之前对于静息态的预处理滤波和去除协变量(6个头动,全脑均值,脑脊液,白质等)是怎样的,谢谢老师!

multiple regression

 你好,我在做抑郁患者和汉密尔顿抑郁量表得分的相关,用的是spm里的multiple regression,当我把抑郁者每个人的图像输进去,再把抑郁得分作为covariates输进去后,发现总是出现以下错误,导致无法建立矩阵,请问这是什么原因啊?

老师,请问做网络和网络之间的效应连接方法

老师:
       您好!最近看了一点关于做几个子网络之间的效应连接的文章,我看到的是先用ICA分离出几个子网络的组分,再进行几个组分之间的效应连接。但是ICA的结果是要自己通过解剖学知识去确定相应的组分对应哪个子网络成分吧,我不是医学生,不太会看结果图。所以想问下还有其他的方法么,麻烦您指点下,或者推荐下相关的文章,谢谢老师!

ALFF

今天试了一下,结果有点让我糊涂了,不如我来描述一下我的处理过程,您来帮我检查一下看妥当否
1、病组和对照组各26个被试
2、DPARSF预处理之前,我想用大脑和小脑的灰质做为mask——我的做法是:用Sliceviewer打开Ch2为underlay,打开AAL为overlay,将Set range of threshold设为(0,116),把连接准则设为5,然后save clusters,生成的文件做为预处理时mask(我这种做mask的方法妥当吗?)。然后计算ALFF及mALFF
3、将病组的所有mALFF文件放在一个文件夹下如DM_mALFF
4、将两组做双样本T检验,我想提取病组增高的脑区的ALFF值(共5个增高的脑区)

fMRI 结构像 矢状位和冠状位的选择

 

Program for z-transformation?

Hello everybody!

向老师请教the default mode network

老师们好,
我正在用ICA方法做病人组及正常人组的DMN提取,想请教几个问题:
1、两组间用GIFT estimate的成分数不同,软件建议选取的成分数为20-40,那么我在处理时两组的成分数是否需要一样?比如都设定是20个成分?还是说可以不同?
2、对成分个数的设定还是不理解,我们应该如何来设定这个值以保证更好的结果呢?根据GIFT estimate的值吗?
3、老师可以解释下GIFT的spatial correlation空间相关性吗? 本人非工科背景。

烦请老师拨冗解答,感激不尽,谢谢!

multiple regression

 你好,我在做抑郁患者和汉密尔顿抑郁量表得分的相关,用的是spm里的multiple regression,当我把抑郁者每个人的图像输进去,再把抑郁得分作为covariates输进去后,发现总是出现以下错误,导致无法建立矩阵,请问这是什么原因啊?

Running "Factorial design specification"
Mapping files                           : Error running job:
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