欢迎到静息态功能磁共振成像论坛
Welcome to the forum of resting-state fMRI

File format

Does ReHo read .nii files as input files instead of .hdr/.img files?

关于REST中统计模块的相关性分析问题

 老师好:
        我利用VBM分析得到13个被试的灰质图,想利用灰质含量的相关性来分析某个ROI和全脑其他脑区的结构连接性,我定义好ROI后,然后得到每个被试的ROI的灰质含量,我把他们放在一个TXT文件里面,把每个被试的全脑灰质图放到一个文件夹里面。然后在REST的统计模块中的REST Correlation Analysis的Add Group Images中添加被试全脑灰质图的文件,在 Add Seed  Variate中添加被试ROI的灰质含量TXT文件。这样运行以后的结果就得到一个.nii文件,这是为什么?不应该TXT文件与每个被试的全脑图做相关得到13个?还是方法有问题?还有我查看得到的那一个.nii文件,设阈值后,有好些激活跑脑外了,这可能是什么原因造成的?谢谢指导~~

关于rest_WriteNiftiImage的问题

 各位老师,
     请问同一批数据,相同预处理条件,都做了空间标准化之后每个被试的head文件是不是除了文件名之外其他都是一样的啊?我想计算一组人的ICC但不知道怎么把算完的结果再写成nifti格式文件,不知道用哪个head文件比较好,我考虑要是head内容都一样的话是不是可以随便选一个?请老师教我。

如何画脑激活图

 老师:
       您好!谢谢您百忙之中的作答!
       对于GCA的方向性连接,我已经对已知脑区得出了结论,但在其结果呈现上遇到了困难,我想将其激活脑区在大脑三维图上呈现,但xjview无法针对GCA的txt文件进行读取和展示,不知道有没有其他软件可以根据我想展示的激活脑区而生成的大脑三维图软件?
       十分期待您的回答!

error occur using DPARSFA

thank you so much for the great tool!!!!

i really appreciate your effort!!

while using DPARSF_V2.3_130615

error occured

it says

Undefined function 'rest_ReadNiftiImage' for input arguments of type 'char'.

Error in y_FD_Jenkinson (line 31)
[RefData, RefHead] = rest_ReadNiftiImage(ReferenceImage,1);

【经验总结】如何根据REST的cl report汇报激活的脑区 How to report the result using REST cl. report

 For more details and figures, please see the attached pdf.

regress covariates of age

老师们好,
我现在有两组年龄相差较为显著的数据,想去除这个年龄的协变量。我知道在two-sample t-test的时候可以加入txt去除协变量,如果我做功能连接呢?在功能连接之前如何可以去除这两组的年龄协变量?DPARSF只可以加入图像的协变量,而REST我注意到是一次只能加一个,怎样可以同时加入这两组的年龄txt去除协变量?烦请老师们解答下,谢谢。

DPARSFA的运行问题

 各位老好:
        我把路径文件参数设置好后,运行DPARSFA老是报错这个信息:
      Error using file_array/subsref>subfun (line 80)

Undefined function 'file2mat' for input arguments of type 'struct'.
 
Error in file_array/subsref (line 60)
    t = subfun(sobj,args{:});
 

rest是否可以做结构态

老师:
       我想问rest主流是做静息态,但是是否可以做结构像的后续处理呢?比如双侧t检验,并提取平均值?

脑区翻转问题

 老师好! 我现在手上有批病人数据,总的数据量还是挺多的,但是这些病人的病灶区不是都在同一侧,分成左右病灶组的话被试的数量就不多了,我现在研究的一个功能区并没有偏侧性,所以我想把这些病人的病灶人为地翻转,使它们在同一侧,之前好像看过一篇文献里提过这种技术但是没细讲实现过程,请问各位老师有什么软件可以做这个或者有什么经典文献?万分感谢啊!!

Syndicate content