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GE机器扫描静息态,DICOM文件导NIFIT文件,生成*.bvec和一个*.bval文件

 老师好:
我用GE机器扫描静息态180个VOLUMES(80个TR),然后要将DICOM文件导成NIFTI格式文件,导完后发现,生成文件是82对,除了需要的80对*.hdr/img文件外,还有一个*.bvec和一个*.bval文件,据我所知,用记事本打开*.bval文件,发现里面是180个1000,据我所知,这两个文件是DTI像时的文件,但是,我们这是RESTING像。
然后我们查了倒出来的图像质量,没有问题。

请问这是为什么呢?会不会影响后续处理?

关于slice viewer 里Alphasim校正的问题

老师们好,在slice viewer 里看Alphasim的校正结果时,框框里输入的P是校正之前的individual P值还是校正之后的alpha P值?也就是说,按Alphasim的结果文档设定好对应Palph=0.05的cluster size之后,此时的P直接填写Palpha,还是填individual P?用xjview可以看Alphasim校正的结果吗?和slice viewer 用看得时候一样吗?谢谢老师们,希望有时间帮我解答一下。

Postdoctoral Fellow – Neuroimaging and genetics (PKU-LIBD)

Postdoctoral Fellow – Neuroimaging and genetics (PKU-LIBD)

关于GRF校正

 老师好:

最近有些疑惑来自GRF校正,希望来这里一起讨论下。

1、看到文章中经常报voxel Z>2.3, cluster level p<0.05;其实这个Z对应的是我们的p=0.01对吗?那么有没有像alphasim那样的一个表格,有Z值和p值的对应关系,还是这个当前的Z就是正态分布下的Z值,当然,如果是这样,由Z值到p值转换也就很简单了。

2、为什么很多文章都是Z>2.3,也就是voxel p<0.01;很少有设定voxel p<0.05的。如果voxel p和cluster p不一样,reviewer会不会问这方面的问题。

功能连接 ROI选择的问题

  老师您好,请教一个问题,我们在做功能连接选择ROI的时候,参照的文献中没有给出相应的坐标,只写了解剖部位,比如left and right OFC等,我们看到REST和DPARSF中均有 Predefined ROI from AAL template by selecting specific area 这个选项,不知该如何选择ROI,请老师指点。

DPARSF v2.2 nuisance regression碰到问题

  严老师您好:

 

谢谢您最新的DPARSF的设计。

我在新版Nuisance signal regression时碰到问题,
感谢您的幇忙!

如何用REST做Gaussian Random Fields校正?

老师,我得到结果想达到corrected cluster threshold of p=.05,请问用REST sliceviewer的Gaussian Random Fields校正里在voxel-level p值和cluster-level分别怎么填呢?

Postdoctoral Positions on Image Registration and Machine Learning

Several postdoctoral positions are available in IDEA lab (https://www.med.unc.edu/bric/ideagroup), UNC-Chapel Hill, NC.

如何去global VMHC?

请问老师,我看到关于VMHC的文献有两个问题想请教一下
1.文献中讲为了只得到局部脑区的信息而非全脑的VMHC,都将global VMHC作为covariates去掉了,但是REST计算了VMHC,我却不知道这个global VMHC是怎么得到的呢?
2.在双样本统计时由于两侧对称了,只需要一个半球灰质作为mask,这个mask是怎么得到,阈值卡多少呢?
先谢谢了

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