Resting-state fMRI topics

Hello friends,

I have been working with 206 resting-state images from http://adni.loni.usc.edu/data-samples/access-data/ . I have been going at this for approximately two weeks with relatively little success. Currently it appears I may be successfully completing slice-timing correction, and then having an error during the realignment stage of preprocessing, but honestly I am uncertain where my error resides.

我想选择脑区中某点的坐标值，然后以坐标点为圆心，选择一半径做成一个小球，然后把这个小球做成mask可以么？？？如果可以这种mask应该怎么做？？？谢谢大家！！！

在 REST SLICE VIEWER 里，如何设置CLUSTER SIZE 的值？还有RMM的值？根据什么 原则了来设定，对结果有哪些影响？多谢！

专家好！

我是新手，可能会是个非常简单的问题，麻烦您帮忙指导。多谢！

在 REST SLICE VIEWER 里，如何设置CLUSTER SIZE 的值？还有RMM的值？根据什么 原则了来设定，对结果有哪些影响？多谢！

用ICA方法处理了一批70个数据没有结果，但之前做过功能连接有结果的，没做过ICA，不知道是不是步骤错了，特来问问各位老师们。

1.用gift软件MDL分析只有10个成分，觉得成分太少了就自己定义了20个成分。

2.运行完之后，用gift软件自带spm对挑选的成分做病人和正常人单样本t检验。在slice Viewer过FDR校正（0.05），save clusters.然后通过image calculator（i1~=0+i2~=0）做并集mask。

用restplus可以顺利进行，但用dpasf就有以下报错，不知为什么：

Dear Rest team

i would like to plot the time series of nuiscance regressors(CSF,WM,Global mean signal).i have  difficult of finding the time series of these regressors.i appreciate it if you can help me

regards

我想做峰值点的fALFF与行为正确率的相关性，但是没有写过了类似的代码，各位能不能给点意见！！！

老师们好，按照臧老师文章的思路，我同时做了患者组的功能，结构的磁共振序列，患者组和对照组的全脑比较。

我把alff,reho,DKI的mk的t图空间标准化后，做了患者组和对照组的全脑比较。

前人的VBM研究发现这种病人的灰质广泛萎缩，DTI研究表明白质的广泛损伤（我的DKI序列比较没有找到白质病变），功能连接的下降。

我发现似乎在我的患者组里面，自发性脑活动增加的区域（额叶ALFF和ReHo升高），同时伴随有灰质结构的同质化（额叶DKI序列的MK值下降）。

我想请教下，这种现象我能如何解释呢? 

另外，我没有直接用FSL或者SPM做了空间标准化，而是用的Restplus和Deparsf做的，这样如果以后发文章，会被质疑么?